Содержание

Проверка тИЦ и PR — мерять пузо и другие части… сайта не зазорно » Статьи

Во времена, когда количество сайтов можно было пересчитать по пальцам рук небольшой компании людей, не было особой необходимости как-либо различать их по качеству, рангу и статусу. В каждом сегменте работали один-два ресурса, и появление нового сайта вызывало бурную радость сетевой общественности одним лишь фактом этого самого появления. Затем наступил момент, когда количество сайтов начало расти сначала в арифметической, а затем и в геометрической прогрессии. Для того чтобы обычный пользователь окончательно не потерялся в этой куче ресурсов, появились поисковые системы. Очевидно, что им потребовались определенные алгоритмы измерения качества и авторитетности сайтов, равно как и соответствующие шкалы ранжирования.

Неудивительно, что реальные формулы вычисления авторитетности сайта с точки зрения поисковых систем эти самые поисковые системы раскрывать не спешат.

Но общественность в любом случае требует подобной «оценочной» информации в том или ином виде. Так и появились понятия тИЦ и PR. О PR (он же PageRank) мы подробно поговорили в соответствующей статье, тИЦ также посвящен отдельный материал. Поэтому не будем тратить время на объяснение этих терминов, а сразу перейдем к основной теме статьи – как проверить PR и тИЦ сайта, и что это дает простым обывателям.

Нерепрезентативный PR и нерегулярный тИЦ для профессионалов

Для профессионалов рынка поискового продвижения проверка тИЦ и PR — служебная необходимость, которая у большинства из них давно автоматизирована и требует лишь наблюдательных действий для последующего реагирования. PageRank в некоторой степени «девальвировал», и этому показателю не доверяют в том, что касается актуального веса ресурса в глазах Google. Поэтому оценка авторитетности отечественных сайтов (например, для покупки ссылок на них) все более основывается на показателях тИЦ. Заявленная Яндексом частота обновления этого показателя раз в две недели нередко нарушается, что вызывает массовые волнения в рядах тех, кто активно работает на рынке купли-продажи текстовых ссылок.

В целом же отношение профессионального рынка к так называемым пузомеркам и их проверке достаточно спокойное и даже в некоторой степени равнодушное. Ведь не зря у профессионалов SEO уже не первый год в ходу поговорка «ТИЦ на выдачу не влияет».

Дополнительный фактор оценки работы оптимизатора

Как известно, непосредственного влияния на позиции сайта в поисковой выдаче ни PR от Google, ни тИЦ от Яндекса не имеют, по динамике изменения этих показателей можно сделать определенные выводы относительно качества и активности работы над ресурсом. Проще говоря, если проверить тИЦ и PR сайта до передачи сайта в работу и сравнить эти показатели в активной фазе продвижения, это послужит дополнительным аспектом оценки работы исполнителя. Если оба показателя стабильно растут, велика вероятность того, что Вашим сайтом занимается грамотный специалист, который хорошо знает свое дело. С другой стороны, если проверка тИЦ показывает хороший рост, а PageRank при этом остается на прежнем уровне, это может быть следствием того, что оптимизатор очень тщательно отбирает ссылки конкретно под Яндекс, и преждевременных выводов о недостаточной квалификации делать не стоит.

Что, где и как?

Проверить тИЦ сайта можно в Яндекс.Каталоге для сайтов, которые в нем описаны. Для других же сайтов эта информация доступна с помощью Яндекс.Бара. Значение PageRank, установившееся для конкретной страницы во время последнего обновления, можно получить посредством Google Toolbar.

Ярослав ШАКУЛА, Demis Group

Полезно 2

Массовая проверка ТИЦ и PR – Как узнать ТИЦ и ПР сайта. Экспорт в CSV

Когда я только начал заниматься продвижением сайтов в Рунете, мне нужен был сервис/программа (желательно бесплатная :)) для проверки ТИЦ и PR, причем не 1-2 сайтов, а массовая проверка ТИЦ и PR – несколько сотен-тысяч доменов.

Зачем проверять такую кучу доменов, —  вы можете спросить? Вариантов много: покупка освобождающихся доменов с хорошими пузомерками, формирование базы сайтов для прогона, проверка потенциальных партнеров для сотрудничества, анализ конкурентов и тд… Сервисов для проверки отдельно ТИЦ или PR или проверки показателей единичного сайта много, но в этой статье мне бы хотелось поделиться наиболее УДОБНЫМИ и РАБОТАЮЩИМИ инструментами для массовой проверки Тематического Индекса Цитирования (ТИЦ) и Page Rank (PR).

Лирическое отступление для начинающих веб мастеров

Что такое PR – самое важное

Page Rank (PR) показывает относительную важность/авторитетность страницы в глазах Google по шкале от 1 до 10. Когда говорят о PR сайта, то обычно имеют ввиду его главную страницу. Например, на сегодняшний день, PR главной страницы YouTube – 9, а PR страницы с видео Gangam Style на YouTube – 8. В расчете PR страницы учитываются как внутренние, так и внешние ссылки, поэтому, в принципе, имея большой сайт можно получить хороший PR страниц за счет внутренних ссылок.

PR пересчитывается в среднем каждые 3 месяца.

Что такое ТИЦ – самое важное

Тематический Индекс Цитирования (ТИЦ) определяется Яндексом для домена, а не для отдельной страницы. Опять же пример — на сегодняшний день ТИЦ основного домена mail.ru – 78 000, ТИЦ субдомена foto.mail.ru – 5600. В расчете ТИЦ учитываются только внешние ссылки, поэтому имея большой сайт, даже с хорошей внутренней перелинковкой, но без внешних ссылок получить хороший ТИЦ нельзя. При расчете ТИЦ большую роль играет тематическая близость ресурсов, то есть ссылка с одного SEO блога на другой SEO блог будет иметь больший вес, чем ссылка с SEO блога на кулинарный ресурс. ТИЦ пересчитывается в среднем каждые 30-40 дней.

Программы для массовой проверки ТИЦ и PR

1. Netpeak Checker

Netpeak Checker — начнем с бесплатной, удобной и мощной программы для массового парсинга показателей сайтов – NetPeak Checker. Помимо популярных SEO показателей, таких как ТИЦ и PageRank, Netpeak Checker позволяет делать парсинг необходимых данных из популярных SEO сервисов, каталогов, сервисов статистики, социальных сетей, позволяя проанализировать сайт по нескольким десяткам параметров.

Установка

Для начала работы нужно скачать и установить дистрибутив программы, при первом запуске нужно получить бесплатный ключ активации, указав email, на который вам будет выслан универсальный ключ для активации любой программы от Netpeak. Netpeak Checker может определять огромное количество показателей для сайта, поэтому, чтобы ускорить процесс, отметьте только те показатели, которые вам действительно нужны.

Внешние SEO сервисы

Для определения отдельных параметров из внешних SEO сервисов, таких как MajesticSeo, Ahrefs, Moz. com, вам необходимо указать в настройках логин и пароль. Для большинства пользователей они не обязательны, но если вам нужна полная картина, причем из нескольких независимых источников, то можно потратить время на регистрацию в этих сервисах, при том что все они предоставляют опцию бесплатного аккаунта.

Список определяемых параметров Массовая проверка ТИЦ и PR Netpeak-Checker (список определяемых параметров)
  • PR – URL Page Rank и главной страницы сайта.
  • тИЦ – тИЦ сайта.
  • IP – IP адрес сервера, на котором размещен сайт.
  • Тематика сайта – тематика сайта, определяемая с помощью запроса в Yandex-Bar.
  • Регион сайта – регион сайта, определяется с помощью запроса в Yandex-Bar.
  • Источник – источник информации на сайте (официальный, коллективный и др.).
  • Адресат – для кого предоставляется информация на сайте (организациям и др.).
  • Сектор – сектор рынка, в котором находится сайт (коммерческий, не коммерческий).
  • Сети – индикация совпадения сетей, в которых находятся анализируемые сайты.
  • Страна сервера – местоположение сервера (страна), на котором расположен сайт.
  • Google index – количество страниц сайта, проиндексированных поисковой системой Google.
  • Google index domain main – количество страниц в основном индексе Google.
  • Yandex index – количество страниц сайта, проиндексированных поисковой системой Yandex.
  • Yandex index URL – факт наличия страницы в индексе Яндекса.
  • Google index URL – факт наличия страницы в индексе Google.
  • Google index URL main – факт наличия страницы в основном индексе Google.
  • Google cache – дата последнего кеширования.
  • Ссылок в Yandex Blog – количество ссылок с блогов Яндекса.
  • blogs.yandex.ru – ссылки с блогов Яндекса.
  • Bing – количество исходящих ссылок на другие ресурсы с проверяемого домена.
  • YACA – наличие сайта в каталоге Яндекс.
  • Yahoo каталог — наличие сайта в каталоге Yahoo.
  • DMOZ – наличие сайта в каталоге DMOZ.
  • LinkPad – кол-во внешних ссылок, доноров, получателей, всего ссылок на сайте, анкоров по данным LinkPad.
  • MajesticSEO – количество внешних ссылок, количество ссылающихся доменов, индекс цитируемости и трастовости домена по данным MajesticSEO.
  •  SEMRush – количество поисковых запросов в ТОП10 Google, разность количество поисковых запросов в выдаче ТОП10 Google по сравнению с предыдущим периодом по данным SEMRush.
  • Мoz – авторитет страницы, авторитет домена, трастовость страницы, трастовость домена, популярность домена и страницы, количество ссылок на домен по данным moz.com.
  • Alexa Rank – рейтинг сайта по данным www.alexa.com.
  • Alexa Rank Local – региональный рейтинг сайта по данным www.alexa.com.
  • Alexa Sites Linking – количество ссылок на сайт по данным www.alexa.com.
  • Склейка G – склейка домена в поисковой системе Google.
  • Склейка Я – склейка домена в поисковой системе Яндекс.
  • Упоминания G – количество упоминаний домена в поисковой системе Google.
  • Упоминания Я – количество упоминаний домена в поисковой системе Яндекс.
  • Site Links – дополнительные ссылки в выдаче Google.
  • LinkStat – статистика внешних и внутренних ссылок главной страницы сайта.
  • Возраст по Web Arch – возраст сайта по данным web.archive.org.
  • Возраст по Whois – возраст сайта по данным whois.
  • Язык – язык текста сайта.
  • Посещаемость – количество посетителей по данным LiveInternet, Rambler, BigMir, Mail.ru (если на сайте установлены соответствующие счетчики).
  • Социальные метрики – количество лайков и репостов в Facebook, Вконтакте, Google +, количество твитов.
Примеры использования

Пример №1. Анализ конкурентов

Проблема: Вы наметили для себя перспективный запрос, под который было бы очень выгодно находиться в топовых позициях в выдаче, но не знаете, насколько сильны сайты конкурентов и как сложно будет их обойти.

Решение: Берем NetPeak Checker и проверяем сайты конкурентов по всем параметрам, чтобы понять с кем мы имеем дело и оценить конкуренцию.

Пример №2. Закуп в биржах ссылок.

Итак, вы хотите купить ссылки на свой проект. Для этого вы используете биржу ссылок. По заданным требованиям биржа выдает список сайтов, на которых вы можете купить ссылки. Но тут возникают две проблемы:

1. Биржа ссылок мониторит ограниченное количество параметров сайтов. И очень часто там нет именно тех, которые нужны вам.

2. Биржи ссылок обновляют параметры сайтов с определенным интервалом. Поэтому результаты, которые вы видите после запроса, могут не соответствовать действительности, ввиду того, что давно не обновлялись.

Решение: Берем NetPeak Checker и проверяем сайты на нужные нам параметры и получаем обширные данные, которые актуальны на сегодняшний день.

Пример №3. Покупка ссылок напрямую у вебмастеров.

На seo-форумах, таких, как forum.searchengines.ru, webmasters.ru можно найти множество предложений от вебмастеров о продаже ссылок со своих сайтов.

Проблема: Необходимо объективно оценить качество площадок вебмастеров.

Решение: Проверяем сайты на всевозможные параметры и отбираем действительно качественные сайты.

Пример №4. Покупка старых доменов.

Очень часто вебмастеры прибегают к покупке старых доменов с хорошими SEO показателями, которые уже кем-то использовались.  В этой ситуации также пригодится NetPeak Checker.

Проблема: Необходимо найти действительно хороший домен с хорошей историей.

Решение: Можно проверить обратные ссылки, проверить возраст домена, историю в Web Archive, количество упоминаний домена в интернете, ну и, конечно, ТИЦ и PR 🙂

Пример №5. Покупка большого количества ссылок у одного вебмастера.

Бывают такие вебмастеры, которые предлагают купить ссылки сразу с сотен или даже тысяч, сайтов. Часто у таких вебмастеров заманчивые цены.

Проблема:  Часто такие сайты находятся на одном IP-адресе, и у поисковых систем могут возникнуть подозрения при одновременном появлении большого количества ссылок с одного IP. Также бытует мнение среди seo-мастеров о том, что ссылки с разных IP работают лучше, чем с одного. Верить этому или нет — ваше решение.

Решение: Пробиваем IP-адреса сайтов и видим совпадающие подсети и их количество.

Использование шаблонов

Для удобства и ускорения работы вы можете создать шаблон, в котором будут отмечены нужные параметры, и использовать его для анализа сайтов. Например, если вы занимаетесь покупкой-продажей доменов — вы можете проверять ТИЦ, PR, возраст и склейку домена в Google и Яндекс. Если вы занимаетесь социальными медиа, то можете создать шаблон, в котором будут анализироваться социальные метрики, такие как количество твитов, лайков и упоминаний в блогах. Если вы анализируете сайты конкурентов, то можете прогнать их по всем параметрам, чтобы понять общую картину и определить насколько сложно будет их обойти в поисковой выдаче. В общем, вариантов много – суть в том, что вы можете подбирать анализ показателей конкретно под свои нужды.

Капча

Если вы проверяете SEO показатели для большого количества сайтов, то имеет смысл обзавестись api ключом для сервиса распознавания капчи, в данный момент, программа поддерживает популярный сервис antigate. com

Прокси

Так как многие SEO сервисы ограничивают количество запросов с одного IP адреса то для того, чтобы обойти это ограничение есть возможность работать через прокси-сервер, делая запросы с разных IP адресов.

Yandex XML

Чтобы ускорить парсинг результатов из Яндекса, можно подключить Yandex XML, указав свой логин и ключ Yandex XML.

Напишите в комментариях, какими сервисами пользуетесь вы.

Фильтры

Так как в большинстве случаев нас интересуют сайты, обладающие определенными показателями, (например: нужно отобрать сайты у которых ТИЦ больше 100 и возраст домена старше 5 лет), то в NetPeak Checker существует возможность фильтрации результатов – задайте условие фильтра по любому из поддерживаемых параметров и нажмите «плюсик» чтобы его активировать.

Экспорт результатов

В любой момент вы можете сделать экспорт рабочей области в эксель таблицу, нажав на кнопочку «Экспорт».

2. CYPR Checker

CYPR Checker — легкая и простая программка для определения ТИЦ и Google PR, также может собирать статистику LiveInternet, ограничения на количество URL нет, но если будете проверять показатели для тысяч доменов не забывайте, что после большого количества запросов с одного IP адреса, Google и Яндекс могут блокировать запросы с вашего IP.

Онлайн сервисы для массового определения ТИЦ и PR

Далее мы поговорим об онлайн сервисах для определения ТИЦ и PageRank. Несомненным плюсом онлайн сервисов является то, что вам ничего не нужно скачивать и устанавливать на свой компьютер, и вы можете воспользоваться ими с любого устройства и в любом месте, где есть интернет.

3. Prlog.ru

PRlog.ru — изначально лимит проверки составляет 25 URL за раз, но если пройти бесплатную регистрацию (30 секунд) то лимит увеличивается до 250 сайтов. Попутно сервис определяет наличие сайта в DMOZ и Яндекс каталоге, ТИЦ, PR, Alexa Rank, поддерживает экспорт в CSV.

4. MainSpy.ru

MainSpy.ru — удобный сервис для определения ТИЦ и PR – поддерживает экспорт в CSV и HTML, имеет ограничение, за раз можно проверить показатели для 50 ресурсов. Так же поддерживает импорт из файлов – csv, dat, txt.

5. Raskruty.ru

Raskruty.ru — простой сервис проверки ТИЦ и PR, результаты выводятся текстовой таблицей, которую можно скопировать в тот же Excel, лимит проверки 100 URL за раз.

6. Msurf.ru

Msurf.ru — единственный онлайн сервис для определения ТИЦ и PR, в котором нет ограничения на количество URL (по крайней мере пока), но, к сожалению, результаты выводятся в виде таблицы с картинками, которую крайне неудобно копировать, а функции экспорта в CSV пока нет.

Напишите в комментариях, какими сервисами пользуетесь вы.

Раскрутка сайта. Как проверить тИЦ, PR?

Показатели сайтов, такие как тИЦ или PR, оказывают существенное влияние на популярность сайта в интернете. Поэтому многих владельцев сайтов волнует вопрос: как проверить тИЦ и PR?

Показатель тИЦ рассчитывается для сайтов поисковой системой Яндекс. Под термином «тИЦ» обычно понимается показатель количества ссылок на сайт с учетом тематики ссылающихся ресурсов, а также их популярности. Другими словами, тИЦ — тематический индекс цитирования — показывает, аналогично индексу цитирования в научной сфере, уровень «доверия» поисковых систем к тому или иному сайту. тИЦ рассчитывается для всего сайта целиком.

В отличие от тИЦ, показатель Google PR (PageRank) отображает «авторитетность» не всего сайта, а отдельных его страниц и для каждой конкретной страницы рассчитывается отдельно.

Зачем нужно проверять тИЦ и PR сайта?

Раскрутка сайта, как правило, включает в себя мероприятия по наращиванию ссылочной массы сайта, т. е. увеличению количества ссылок на сайт: чем больше ссылок на сайт размещено в интернете, тем больше интернет-пользователей смогут узнать о сайте и посетить его. При этом имеет значение, какой именно ресурс ссылается на раскручиваемый сайт.

Если ссылающийся ресурс соответствует тематике раскручиваемого сайта, если такой ресурс посещает большое количество интернет-пользователей, то ссылки с данного ресурса полезны для раскручиваемого сайта. И, наоборот, ссылки с ресурсов с подозрительной репутацией вредят раскрутке и продвижению сайта.

Поэтому проверить тИЦ и PR ресурса, который ссылается на сайт, очень важно для оценки эффективности такой ссылки. Так, даже тысяча ссылок на сайт с немодерируемых (т. е. не проверяемых) форумов, досок объявлений, каталогов и прочих подобных ресурсов будет совершенно бесполезна в раскрутке и продвижении данного сайта.

Как именно можно проверить тИЦ и PR сайта?

Наиболее универсальный способ проверки показателей тИЦ и PR — это проверка в соответствующих поисковых системах.

Например, в каталоге сайтов поисковой системы Яндекс (Яндекс. Каталог) тИЦ отображается вместе со описанием сайта, находящегося в каталоге. Также можно установить в свой браузер специальную панель инструментов от Яндекс — Яндекс.Бар. На этой панели указывается значение индекса цитирования для каждого отображаемого сайта.

Проверить PR страниц сайта можно с помощью специальной панели инструментов для браузера от Coogle — Google Toolbar. Инструмент этой панели “PageRank” показывает текущий PR открытой в браузере страницы.

Можно проверить тИЦ своего сайта, установив на нем специальную кнопку, например «денежку» от Яндекс. Есть также много подобных кнопок от частных сервисов, выбор которых индивидуален.

Помимо указанных способов, быстро и удобно можно проверить тИЦ и PR сайта с помощью различных онлайн-сервисов проверки. Как правило, подобные сервисы предлагают еще множество других, полезных для раскрутки и оптимизации сайта, функций.

Одним из таких сервисов является сервис SEO-анализа страниц от студии веб-дизайна WebStudio2U. С помощью данного сервиса можно в считанные секунды не только проверить PR и тИЦ сайта, но и узнать другие, полезные для раскрутки сведения, такие как:

  • количество внешних и внутренних ссылок сайта, количество обратных ссылок;
  • количество вхождений, плотность и вес ключевых слов на странице сайта;
  • наличие сайта в популярных интернет-сервисах, каталогах и рейтингах;
  • значения мета-тегов проверяемой страницы.
Теги:

тиц, проверить тиц, как проверить тиц, проверка тиц, seo-анализ, проверить pr

SEO | ООО «ОЙЛ-ТЕЛЕКОМ»

Список SE0 сервисов
Определение позиций в поисковиках

» http://www.mediaplaner.ru — русский сервис определения позиций во многих поисковых
системах (Yandex, Rambler, Rambler Top 100, Google, Aport, Mail, Web Alta, MSN,
Alta Vista, Yahoo).

» http://www.onlineseo.ru — русский сервис определения позиций в поисковых системах,
имеются возможности ведения отчетов по продвижению вашего сайта в поисковиках
и контроля ссылок.

» http://www.siteposition.ru — русский сервис контроля позиций сайтов в поисковых
запросах и рейтингах. Помогает определять позиции в поисковиках, отслеживать
их изменения, анализировать позиции одного или нескольких сайтов по конкретным
запросам и следить за динамикой позиционирования в выдаче результатов поиска.

» http://sitecreator.ru — русский сервис определения позиций во многих поисковых
системах (Yandex, Rambler, Meta.ua, Google, Aport, Mail, MSN, Yahoo). Имеется
возможность ведения отчетов.

» http://seo-monitor.ru — русский сервис определения и мониторинга позиций
сайтов в поисковых системах по заданным запросам. Система разделена на 2 независимых
сервиса: on-line сканер (предназначен для моментального определения позиции
вашего сайта в поисковых системах ) и off-line сканер (предназначен для мониторинга
положения вашего сайта в поисковых системах).

» http://www.goldposition.ru — русский интернет-сервис, призванный решить часто
встречаемую проблему среди веб-мастеров. Сервис позволяет узнать, на каких местах
находится интернет-сайт в ведущих российских и мировых поисковиках — Yandex,
Rambler, Google, Aport, Mail. Роботы сервиса регулярно сканируют информацию
и выявляют, на каких местах в поисковых результатах находится ваш ресурс, что
позволяет в перспективе: оценивать развитие ресурса, “признание” его популярности.

» http://www.seocompany.ca — буржуйский сервис определения позиций в Google
и Yahoo. Множество разнообразных сервисов и утилит.

» http://www.seodesign.ru — русский сайт, на котором можно найти такие утилиты:
определение характеристик групп доменов, whois, проиндексированные ссылки, определение
осмысленных 4-х и 5-и буквенных доменов.

» http://baza.garb.ru — русский сайт с набором разнообразных сео-скриптов, таких
как яндекс-аналитик и конвертор баз данных.

» http://www.seo-matik.ru — русский сайт с набором полезных сервисов, таких
как определение рейтинга в поисковых системах, регистрация в поисковиках, robots. txt
глазами яндекса, статистика запросов.

» http://seop.ru — русский сайт с огромным набором разнообразных утилит, таких
как определение позиций сайта, определение PR, популярность ссылок и многое
другое.

» http://seotools.altervision.ru — русский сайт с утилитами по определению позиций
вашего сайт в поисковиках, определения популярности запросов и многое другое.

» http://www.seochat.com — буржуйский сайт с действительно огромным количеством
полезных утилит: поиск ключевых слов, определение alexa rank, определение PR,
анализаторы мета тэгов и многое другое.

» http://webmastertools.narod.ru — русский сайт, находящийся на фрихосте, но
с достаточно хорошими утилитами: определение позиций в поисковиках, определение
Page Rank, подбор ключевых слов и многое другое.

» http://www.r-cat.info — русский сайт с набором промо сервисов для оптимизаторов:
определение позиций, добавление в поисковики, определение тИЦ и PR.

» http://www.top25web.com — буржуйский сайт, на котором можно найти такие утилиты:
определения PR, популярность ссылок, ip ping и многое другое.

» http://www.webuildpages.com — буржуйский сайт со сборником разнообразных бесплатных
утилит для оптимизаторов и web-мастеров.

» http://www.seologs.com — буржуйский сайт, на котором находится множетсво полезных
утилит и сервисов для продвижения.

» http://www.iwebtool.com — буржуйский сайт с набором наиболее часто используемых
сервисов для продвижения сайтов в иностранных и наших поисковых машинах.

» http://www.seo-tools.deria.ru — русский сайт, на котором можно найти такие
утилиты: проверка тИЦ и PR, а также позиций сайта в поисковых системах по заданным
запросам.

» http://www.intop20.com/ — выдача top50 c американского ip для (google,msn,
yahoo)

» http://www.raznoves.ru — русский сайт с огромным набором сервисов и утилит
для Яндекса, таких как парсер выдачи, определение ключевых слов, определение
позиций сайта, определение тИЦ, определение количества внешних ссылок и многое
другое. (new)

» http://www.iwebtool.com/search_engine_position- определение позиции сайта
в Гугле и Яху (new)

Анализ сайта

» http://www.yandextools.ru — Бесплатный Online-сервис для анализа конкуренции
в ПС Яндекс по заданному слову. Возможность анализа как TOP10, так и любого
сайта. Разделение ссылающихся страниц на главные и остальные. Определение типа
ссылающейся страницы (каталог, форум, доска и т.п.).

» http://netpromotion.ru — русский он-лайн сервис анализа вашего сайта. Показывает
индексированность вашего сайта, его видимость в поисковиках по запросам, определяет
тИЦ и PR, а также выполняет множетсво других функций. Жаль, что работает только
под Internet Explorer.

» http://www.seomozg.ru — русский он-лайн сервис глобального анализа вашего
сайта. Возможности: сводный анализ сайта, анализ ссылочного бюджета, мониторинг
параметров сайта. Сервис платный!

» http://www.yourcache.com — буржуйский сервис, показывающий, какие страницы
вашего сайта проиндексированы различными дата центрами поисковой системы Google.

» http://www.seoman.ru — русский он-лайн сервис анализа страниц сайта. Возможности:
камуфлирование по робота поисковой системы, анализ ссылок на странице и их индексация,
выявление наличия счетчиков и анализ robots.txt.

» http://promolab.ru — русский on-line сервис. Этот скрипт анализирует вашу
страницу на предмет ее видимости поисковой машиной, ключевых слов и заголовков.
В программе реализована поддержка псевдоморфологии, которая анализирует слова
в разных словоформах.

» http://www.stat.incomestudio.com — руский on-line сервис, который позволяет
посмотреть показатели сайта тИЦ, ПР, статистику по поисковикам Апорт, Яндекс,
Рамблер, Google, Yahoo. Сервис поможет оптимизаторам быстрее и легче продвигать
сайты в поисковых системах.

» http://www.giper.info — небольшой но функциональный набор инструментов, необходимых
при поисковой оптимизации сайтов.

» http://www.be1.ru — уникальный по возможностям и функционалу русский on-line
сервис, который позволит в кротчайшие сроки произвести анализ вашего сайта.

» http://linum.mohito.ru — русский сервис подсчета ссылок на странице, тИЦ сайта
и PR страниц.

» http://www.dinews.ru — русский он-лайн сервис со следующими возможностями:
анализатор страниц, беклинков, PR и тИЦ, проверка присутствия в Яндекс.Каталоге,
Рамблер-TOP-100 и DMOZ.

» http://www.promoting.ru — достаточно функциональный и многоплановый русский
он-лайн сервис для анализа вашего сайта.

» http://www.se-inspector.com — буржуйский он-лайн сервис по анализу вашего
сайта и анализу ключевых слов на его страницах.

» http://www.chelbis.ru — русский он-лайн сервис, который помож найти вам КПД
вашего сайта, и его функциональности в интернете.

» http://www.mcdar.net — буржуйский сервис, дающий удобное представление проиндексированных
Google страницы по различным датацентрам.

» http://www.way2seo.com — буржуйский сервис Google Datacenters Checker Tool
— индексированые страницы, бекварды и PR. Статистика по разным датацентрам.

» http://www.webtoolscafe.com — буржуйский сервис, который осуществляет проверку
количества страниц проиндексированных поисковыми системами: AllTheWeb, AltaVista,
Google, MSN Search, Yahoo.

» http://seanalyzer.ru — анализ выдачи Яндекса, анализ сайтов

» http://www.align.ru/ — WEB аналитик может собирать статистику по посещаемости
сайта за несколько прошлых месяцев, анализировать динамику изменения посещаемости,
сравнивать результаты посещаемости разных сайтов.

» http://seo-rus.com/ — Данный сервис позволяет узнать показатели: Индекс цитирования
(тИЦ), PageRank (PR), узнать кол-во ссылающихся сайтов по Яндекс и Google, получить
статистику по Яндекс, Rambler и многое другое.

» http://seolab.ru/add/header.htm — Сервис проверки HTTP-заголовков, отдаваемых
web-сервером (new)

» http://search.liveinternet.ru/cgi-bin/se/rate.pl — Оценка эффективности оптимизации
сайтов.

» http://www.ifstudio.org/seo/viewer. php — Инструмент позволяет вам увидеть
HTTP заголовок веб-страницы глазами поисковых роботов и браузеров (new)

» http://www.iwebtool.com/google_banned — проверка на бан в гугле

Анализ плотности слов

» http://vface.controlstyle.ru/ns.php — анализатор плотности слов, оценка “тошноты”
страницы (new)

» http://www.prosait.com/promotion — анализатор плотности слов

» http://www.ifstudio.org/seo/count.php Инструмент помогает определить в тексте
общее количество слов, предложений и символов, включая пробелы и запятые. Может
быть востребовано, к примеру, переводчиками или SEO-оптимизаторами.

» http://seo.bigli.ru/ — Определение плотности ключевых слов

Определение PR

» http://livepr.raketforskning.com — буржуйский сервис для определения Google
PR для страниц сайтов по дата центрам.

» http://dkameleon.com — буржуйский сервис для массового определения Google
PR.

» http://www. pageranktool.net — буржуйский сервис для определения Google PR
для страниц сайтов.

» http://www.iwebtool.com — буржуйский сервис для определения ПР страниц вашего
сайта.

» http://www.rus-forum.com — русский сервис для предсказания будущего Google
PR для любой страницы вашего сайта.

» http://www.futurepagerank.net — буржуйский сервис для предсказания будущего
Google PR для любой страницы вашего сайта.

» http://www.golubeff.ru — русский сервис по предсказанию будущего ПР указанной
страницы вашего сайта.

» http://www.seocompany.ca — сервис, содержащий информацию об истории апдейтов
Google Page Rank.

» http://linkclub.ru/pr.php — массовое определени PR

» http://pr-cy.ru/ — Проверка тИЦ и PR, счетчик определения тИЦ и PR.

» http://wtools.biz/ — ещё один хороший сервис для определения PR и тИЦ. Его
плюс в том, что его можо вписать в любой дизайн, плюс юзабилити сервиса на высоте.

» http://www. tm-research.com/products/tmwsa/google-site-analyzer.html — определение
ПР страниц

» http://www.iwebtool.com/pagerank_prediction- определение ПР

» http://www.iwebtool.com/multirank — мульти ПР чекинг

» http://www.iwebtool.com/visual_pagerank — определение ПР

» http://www.iwebtool.com/rank — определение ПР

» http://www.prsearch.net — определение ПР, позиций сайта и т.п.

SiteSpy.Ru :: Анализ сайта, проверка тИЦ и PR

Загружается! Дождитесь окончания сбора данных.

Зачем проводить анализ сайтов?

Для того, чтобы сделать работу сайта максимально эффективной, обязательно нужно периодически проводить его анализ. Это позволит вам обзавестись всей необходимой информацией, которая потребуется для оптимизации и последующего развития сайта. Благодаря анализу становится возможным выявление всевозможных ошибок и слабых мест ресурса, а также предотвращение появления новых. Проведя анализ вы получите все необходимые данные касательно вашего сайта. Без предварительного анализа не рекомендуется вносить на сайт какие-либо серьезные изменения, поскольку это может привести к неизвестным последствием. Поэтому, специалисты рекомендуют сначала сделать все проверки, выявить сильные и слабые стороны, а уже потом разрабатывать схему действий по оптимизации сайта.

Какие данные можно получить с помощью проверки домена?

  • Выполнив несложную проверку вашего домена, можно будет просмотреть такую информацию:
  • Показатель тИЦ Яндекса;
  • Числится ли ваш ресурс в Яндекс-каталоге;
  • Сколько страничек сайта уже находится в индексе основных поисковых систем;
  • Сколько раз упоминался ваш домен;
  • Исчерпывающий перечень ссылающихся страниц.
  • Помимо этого, есть возможность посмотреть и основные данные о сайте, такие как его возраст, хостинг-провайдер и IP адрес.

Можно ли анализировать чужие сайты?

Также вы можете получить нужные данные и о других доменах. Всю информацию, которая является доступной вы сможете просмотреть, а также есть возможность узнать какой класс веб-сервера используется, какая на нем операционная система и система управления сайтом. Кроме того, можно просмотреть данные WhoIS, а также заголовок ответа сервера. Данная информация может пригодится вам и для детального изучения своих ресурсов.

Насколько часто нужно делать анализ сайта?

Сразу стоит отметить, что информация, которую вы получите в ходе такого анализа является основной, соответственно изменяется она не слишком часто, поэтому каждый день проводить повторную проверку данных не нужно. Но и полное исключение такого анализа делать нельзя. Профессионалы советуют делать анализ сайта примерно раз в месяц. Такая периодичность позволит вам увидеть все произошедшие изменения и исключить всевозможные погрешности в подборке статистических данных.

Можно ли сделать SEO анализ сайта?

С помощью нашего сервиса вы можете также проанализировать и контент, которым наполнен ваш ресурс. Благодаря этому вы сможете просмотреть список заголовков на вашем сайте, а также узнаете сколько внешних ссылок на него ведут. Помимо этого, такой анализ позволит вам вывить наиболее конкурирующие с вами сайты. Соответственно, далее вы сможете сделать проверку и этих конкурентов, чтобы обнаружить все их плюсы и минусы по сравнению с вашим сайтом, а затем разработать планы необходимых изменений для улучшения эффективности работы сайта.

Проверка, анализ сайта онлайн бесплатно сервисы

В статье показаны сервисы проверки (анализ сайта онлайн), позволяющие провести SEO аудит (посещаемость, стоимость, наличие в каталогах, ТИЦ,PR, контент, проиндексированные страницы, изображения и др.) просмотр позиций по ключевым словам в поисковых системах, подбор ключевых слов. На этом проекте есть услуга бесплатного SEO аудита, позволяющая провести SEO анализ сайта, осуществляемый вручную.

Проверка сайта онлайн и оффлайн.

 Комплексный анализ сайта для продвижения и SEO оптимизации выполняют как онлайн, так и оффлайн сервисы (программы на локальном компьютере, о которых рассказывается ниже), например SiteAuditor, основной функцией которой является проверка позиций.  Проверка сайта осуществляется множеством SEO сервисов, которые предлагаются на выбор:

Сервисы, проводящие анализ сайта онлайн:

Практически все анализаторы, которые предоставляют SEO анализ сайта онлайн, пользуются услугами качественных интернет сервисов, таких как solomono.ru, — мониторинг внутренних и обратных ссылок, позиции от megaindex.ru, рейтинг alexa.com, архивы archive.org, посещаемость от Liveinternet и другие. Но у каждого сервиса есть особенности.

 SEO расширения, проводящие анализ сайта онлайн для браузеров.

— Проверка ТИЦ и PR сайта непосредственно в браузере онлайн. Проверка сайта данным расширением достаточно информативная и точная. Для определения SEO показателей как своего, так и других проектов существуют различные расширения для разных браузеров. Рекомендуется пользоваться двумя  расширениями, которые сразу показывают в окне браузера показатели ТИЦ и PR. На изображении показаны RDS bar (скачать можно на официальном сайте recipdonor. com и в магазине: chrome.google.com) и PageRank Display, которые в свернутом состоянии показывают соответственно ТИЦ (на рисунке 100) и PR страницы, причем, если PR не присвоен, PageRank Display показывает PR главной ( на рисунке 3h) скачать можно по адресу: nemrod.se/chrome-extensions/pagerank-display/ иди в магазине chrome.

При нажатии на значок RDS bar всплывает окно в котором показывается комплекс сервисов: PR, ТИЦ, индексация, наличие в основных каталогах, беклинки, alexia rank, и др.

Если на значке RDS bar нажать правой кнопкой мыши, можно войти в настройки расширения

включить панель RDS bar в, которая будет показываться в окне браузера сверху результатов поиска.

В браузере Mozilla Firefox RDS bar выглядит несколько иначе. Нажав на кнопку программы в настройках можно поменять вывод информации как в панели браузера при открытом анализируемом ресурсе, так и в результатах поиска (на рисунке — в Яндексе).

Основным преимуществом расширения RDS bar является подсветка открытых ссылок, закрытых nofollow и no index, оформление которых можно настроить под себя. Подобные расширения, показывают ТИЦ и PR после нажатия на них: Yandex CY (TIC) & PR Viewer, Yandex TYC + Google PR indicator, SEOquake (аналог RDS bar). Скачать бесплатно расширения для google chrome можно в интернет магазине chrome.google.com/webstore. Для других браузеров на собственных ресурсах.

seobuilding.ru — старый адрес. Новый sbup.com — Подробный SEO анализ сайта онлайн. Сервис дополнительно пробует вычислять реальный PR страниц. Рассчитывает стоимость. Трастовый каталог. Есть Seo Форум с которого можно получить открытые беклинки на себя. Недостаток: неверно показывает проиндексированные изображения. Для правильного вывода картинок в Гугл необходимо вводить в поиск по картинкам «site:ваш домен»  в поиске по картинкам яндекс вводить host:ваш домен. Проверка сайта на этом сервисе эффективно позволяет отслеживать изменение параметров анализируемого проекта.

pr-cy.ru — SEO анализ сайта онлайн. Сервис использует инструменты: онлайн SEO проверка сайта на оптимизацию по ключевому слову, текста на уникальность, скорости.  SEO анализ сайта на контент, текстов используя закон Ципфа, внешних и внутренних ссылок на странице. Как выглядит ресурс глазами поискового робота. Счетчик тИЦ и PR, Массовая проверка доменов, доступность, трейс, пинг, http-заголовки и др. скорость подключения вашего интернета, и скорость загрузки. Информация браузера, настоящий IP, хостер и его расположение. Анализ твиттер аккаунта, Создание превью, Загрузка изображения в шаблон браузера Safari. Создание Favicon, Шифрование MD5, Whois, IP, а также доменные имена на занятость в любых зонах.Генерация robots.txt, Создавайте правильный файл robots для поисковых роботов. Генерация пароля, проекты на одном IP, Генератор анкоров, Подсчет длины текста, Словарь русских синонимов, Шифрование HTML в формат javascript. 

 

webdomainservice.net — SEO анализ сайта онлайн по параметрам: 

ТИЦ, Google Page Rank, Количество ссылок в Yandex, Google, Yahoo, Количество страниц в индексе Yandex, Google, Yahoo, Количество ссылающихся доменов по Majesticseo и уникальных IP адресов по Ahrefs и по Majesticseo, Всего ссылок по Majesticseo, по Ahrefs, Количество проиндексированных страниц Majesticseo, Ahrefs, Alexa Traffic Rank,Ahrefs, Alexa Traffic Rank.   Дата регистрации, Доменная зона, Информация о зеркале домена в Google и Яндекс (клей), Наличие домена в Каталоге Яндекс, Наличие домена в Каталоге DMOZ, Ahrefs, Alexa Traffic Rank, Трафик, цену домена, тип аукциона/продажи и другие параметры.


prlog.ru — SEO анализ сайта онлайн, особенностью сервиса является массовая проверка PR страниц, достаточно ввести главную и другие страницы будут добавлены автоматически с их показателями. Дополнительно предлагает создать автоматические беклинки, которые необходимо скопировать и проиндексировать.  

seo-monster.ru — SEO анализ сайта онлайн. Показывает основные параметры, плюс внешние и внутренние ссылки на главной, их стоимость. Есть свой форум. Сервисы: Информеры. Аудит. Определение стоимости. Массовая определение ТИЦ и PR. Шифрование в MD5. Онлайн генератор паролей. Скорость Интернета. Узнать ваш IP адрес. Генератор уникальных фраз. Сервис Whois.

cy-pr.com — Проверка сайта онлайн. Есть Seo Форум. Используются инструменты: Добавление в социальные закладки. Счетчики тиц и PR. Возможность выбора дизайна информера. Массовая проверка тИЦ и PR у нескольких проектов одновременно. Инструмент для определения PageRank всех внутренних страниц. Оптимизатор css кода. Анализ контента. Как выглядит ресурс в глазах поисковых роботов. Бесплатная оценка на основании тИЦ, PR, посещаемости. Генератор META — тегов по заданным параметрам.  Favicon генератор. Шифровальщик (Encoder) для HTM. Генератор sitemap.xml. Создание HTML и CSS кнопок. DNS записи. WHOIS. Проверка доменов на занятость, скорости интернет, ответа сервера, HTTP статусов. Информация о владельцах. Регистрация доменов. Подсчёт длины текста. Транслит переводчик. Конвертеры RGB, HEX, CYMK цветов. Узнать IP адрес. Seo Форум для Вэбмастера и SEO оптимизатора. Скрытие текста от спам-ботов. Оценка стоимости.

            

seo-assistent.net — Полная проверка сайта онлайн с применением инструментов: Анализ контента, текста, внешних и внутренних ссылок; Генераторы ключевых слов,  файлов robots. txt, статических URL, уникальных ссылок, ключевых слов с текста, иконки FavIcon, паролей,  заголовков (title),  META тэгов, опечаток слепой печати. Доступность Ping\Tracerout, Проверка сайта на беклинки, Google PageRank по датацентрам, Извлечение ссылок, Оценка стоимости ссылки, Кодирование\Декодирование, Конвертер кирилл. домена (Punycode), WHOIS владельца домена, WHOIS IP, Получение ip, Получение сервера, Просмотр заголовков, Массовая проверка сайта на посещаемость по LI, PR\ТиЦ, доменов на занятость, скорости, ресурс глазами поискового робота, Извлечение E-Mail адресов, Информер PR и ТиЦ, Информеры апдейтов поисковых машин. Транслит переводчик текста, Процентное сравнение текста, Шифрование строк, Удаление дубликатов строк, Экранирование\Де спец. Символов, Зашифровка HTML в код JavaScript, Упаковка кода JavaScript, Упаковка кода CSS, Нанесение текста на изображение,  Информер IP адреса, CSS Sprites — объединение изображений, скорость соединения с интернет, Информация о Вашем IP, браузере, кодирование текста.

webmasters.ru — Проверка сайта онлайн. На этом сервисе SEO анализ сайта онлайн дополнительно включает определение позиций по 30 запросам. Есть свой форум, но зарегистрироваться на нем можно только получив инвайт (код от уже зарегистрированных участников).


analizsaita.com — Адрес говорит сам за себя — анализ сайта. Недавно переехал со старого адреса mainspy.ru, чтоб применить более качественные услуги. Определение PageRank и ТИЦ домена; Индикатор апдейтов выдачи, ТИЦ и PR; код состояния HTTP сервера; Проверить индексацию страниц или ресурса в целом; Перевод кириллицы в транслит для URL; Определение скорости загрузки сервера; Массовый генератор ссылок и текстов; SEO анализ сайта онлайн на ссылки; Сервис создания html-кода гиперссылок; Проверка сайта на WHOIS информацию домена; Поиск страниц релевантных запросу; Узнать IP адрес и принадлежность к стране; Генератор кода HTML цвета в RGB и HEX; Работа с текстом, подсчет символов и т.д.; Добавить в Яндекс и Google поисковики; Обмен WebMoney и Яндекс Деньги; ФОТОШОП ОНЛАЙН НА РУССКОМ; Тестирование интернет соединения.

Дополнительно показывает видимость в топе от мегаиндекс.


xseo.in — SEO анализ сайта онлайн LITE, ТИЦ и PR, индексация, позиции, бэклинки, упоминание в социальных сетях, Индексация V2, склейки, Массовая проверка сайта на склейки, IP адресов, IP в DNSBL, Анализ страницы, pr и тиц списком, домены списком, Whois сервис, Быстрый поиск домена, исходящие ссылки, Подбор ключевых слов, уникальность текста, валидность ссылок, IDN — Punycode конвертер, Просмотр DNS записей, Список доменных зон, Информация по IP, Проверить сервер, IP адресу, доступ к ресурсу, прокси, Утилита PING, Traceroute IP.

xtool.ru — Проверка сайта онлайн на этом сервисе представляет данные: Ссылки — внешние\внутренние, заспамленность оценка трафика,  Санкции в Яндексе, АГС, Вероятность фильтра, Раскрученность в Yandex, Раскрученность в Google, Возраст, дней (лет), Индексация в Яндексе, Скорость обновления по Яндексу (страниц/сутки), Тиц и PR. Видимость в Яндекс и Google от мegaindex.ru. Наряду с многими инструментами и услугами также предоставляет SEO анализ сайта онлайн.

 

 

Как проверить ТИЦ и PR сайта?

Привет, друзья! Сегодня мы займемся проверкой волшебных показателей наших сайтов, называемых ТИЦ и PR. Волшебные они потому, что их рост чудесным образом повышает доходы от некоторых видов рекламы. Как раз вчера поисковая система Google провела очередное обновление рейтинга сайтов в своей базе, точнее даже не сайтов, а страниц, так как google page rank (PR) рассчитывается для каждой страницы в отдельности, об этом я писал в статье о об авторитетности сайтов.

В отличие от Яндекса, который проводит пересчет всех рейтингов довольно часто (примерно каждый месяц), google делает это значительно реже, до этого мы были свидетелями пересчета аж в апреле 2010.

Способы проверки ТИЦ и ПР сайта

1. Использование для проверки сервиса pr-cy.ru

Это довольно простой ресурс, на котором необходимо ввести адрес проверяемого сайта и вы мгновенно получите нужные данные. Кроме ТИЦ и PR он покажет еще много всяких данных. Кроме того, он позволяет взять специальный код, разместив который на своем сайте вы получите кнопочку, показывающую ваш ТИЦ и PR (большая цифра показывает ТИЦ, маленькая внизу PR).

Данные на этой кнопке меняются автоматически, так что следить и обновлять их не нужно. Правда, стоит отметить, что обновление значение идет с задержкой. Апдейт значений в поисковой системе уже прошел, а изменения на индикаторе мы можем увидеть через много дней.

Единственный недостаток этого сервиса заключается в том, что он показывает параметры главной страницы сайта, а мы знаем, что значение PR считается для каждой страницы в отдельности.

2. Плагин для браузера Mozilla FireFox – SeoQuake

Этот плагин (что такое плагин читайте здесь) предоставляет очень много полезной информации по сайту и его страницам. Определяемые параметры можно настраивать, включая нужные (ТИЦ, PR и т.д.) и исключая то, что вам не требуется. Он очень полезен как для анализа своих сайтов, так и для проверки чужих проектов. Я пользуюсь его функцией seobar, вот как она выглядит в моих настройках:

У меня выведены следующие показатели: PR, количество проиндексированных в Google страниц, AlexaRank, ТИЦ, количество страниц проиндексированных в Яндексе, количество ссылок на странице (внутренних/внешних).

Все это сразу показывает как выглядит сайт и отдельные его страницы в глазах обеих важных поисковых системах Яндекс и Google.

3. Сервис для анализа сайта xseo.in/ipr

Если вы не пользуетесь Mozilla FireFox или не хотите устанавливать плагин для браузера, но иногда вам требуется узнать о тех или иных параметрах, то идеальный вариант использовать этот сервис.

Указанная в заголовке страница ведет на раздел, который показывает PR конкретной страницы, одновременно можно проверять несколько страниц. Для этого просто вводите адрес каждой из них в поле, а потом жмете кнопку проверить PR.

Кроме измерения пузомерок этот сервис умеет еще много чего. Почитайте о его функциях в правой части сайта, быть может что-то из этого вы давно искали. Для определения других параметров достаточно выбрать нужный из меню и внести исходные данные.

Дизайн у сайта довольно простой, без наворотов, но, до сих пор, в этом сервисе я находил все что мне требовалось, так что рекомендую.

В заключение хочу сказать, что существует много и других способов проверить ТИЦ и PR на сайте. Среди них есть множество плагинов и расширений для браузеров (не только SeoQuake), причем эти расширения работают и в Google Chrome и во многих других.

А сервисов, наподобие тех, что я описал еще больше. Каждый из них умеет определять основные характеристики сайтов, а некоторые, как и xseo, проводят глубокий анализ.

Но не стоит увлекаться рассмотрением цифр вашего сайта, лучше уделите время развитию своего проекта, пользы будет больше.

Хотя сегодняшняя статья и касается чисто измерения ТИЦ и PR, я все таки хочу пару слов сказать о том, для чего нужны эти пузомерки. Возможно, вам это пригодится.

На что влияет ТИЦ и PR

1. Место сайта в результатах поиска

Если говорить про Яндекс, то это миф. ТИЦ не влияет на поисковую выдачу никоим образом. Именно по этой причине в ТОПе по многим запросам некоммерческих тематик могут соседствовать нулевые сайты и большие трастовые порталы с индексом цитирования в несколько тысяч.

В отношении Google позиция иная. Его рейтинг страниц влияет на место сайта в выдаче. Естественно, это не самый значимый фактор, но при прочих равных условиях сайт с большим PR будет выше.

2. Доходы от ссылочной рекламы

Ссылочный фактор ранжирования в работе поисковых систем имеет немалое значение, поэтому продвигаемые сайты активно покупают ссылки. Но, значимость ссылок с разных сайтов и разных страниц существенно отличается. И в этом плане ссылки с сайтов имеющих большой ТИЦ приносят больше пользы для продвижения в Яндекс. А странички с большим PR неплохо помогают в продвижении под Google.

Соответственно, чем выше эти показатели на вашем сайте, тем больше вы можете запросить за размещение чужих ссылок.

Загрязнение твердыми частицами | Воздух | CDC

Загрязнение твердыми частицами, также называемыми твердыми частицами (ТЧ), состоит из частиц (крошечных кусочков) твердых или жидких веществ, находящихся в воздухе. Эти частицы могут включать:

  • Пыль
  • Грязь
  • Сажа
  • Дым
  • Капли жидкости

Некоторые частицы достаточно большие (или кажутся достаточно темными), чтобы их можно было увидеть — например, в воздухе часто можно увидеть дым. Другие настолько малы, что их не видно в воздухе.

Откуда происходит загрязнение частицами?

Загрязнение твердыми частицами может происходить из двух разных источников — первичных и вторичных. Первичные источники сами по себе вызывают загрязнение частицами. Например, дровяные печи и лесные пожары являются первоисточниками.

Вторичные источники выделяют газы, которые могут образовывать частицы. Электростанции и угольные пожары являются примерами вторичных источников. Некоторые другие распространенные источники загрязнения частицами могут быть первичными или вторичными — например, фабрики, легковые и грузовые автомобили, а также строительные площадки.

Дым от пожаров и выбросы (выбросы) электростанций, промышленных объектов, легковых и грузовых автомобилей содержат PM 2,5 .

Загрязнение твердыми частицами и ваше здоровье

Вдыхание твердых частиц может нанести вред вашему здоровью. Крупные (более крупные) частицы, называемые PM 10 , могут раздражать глаза, нос и горло. Пыль с дорог, ферм, высохших русел рек, строительных площадок и шахт — это типы PM 10 .

Мелкие (более мелкие) частицы, называемые PM 2.5 , более опасны, потому что они могут попасть в глубокие части легких или даже в кровь.

Как загрязнение воздуха частицами может повлиять на мое здоровье?

Загрязнение твердыми частицами может затронуть кого угодно, но одних оно беспокоит больше, чем других. Люди, которые, скорее всего, столкнутся с последствиями для здоровья, вызванными загрязнением частицами, включают:

  • Люди с заболеваниями сердца или легких (например, астма)
  • Пожилые люди
  • Младенцы и дети

Если у вас астма, загрязнение частицами может ухудшить ваши симптомы. Тщательно следуйте своему плану лечения астмы в дни, когда уровень загрязнения высок.

Загрязнение твердыми частицами также связано с:

  • Раздражение глаз
  • Раздражение легких и горла
  • Проблемы с дыханием
  • Рак легкого
  • Проблемы с младенцами при рождении (например, низкая масса тела при рождении)
Болезнь сердца

Если у вас болезнь сердца, вдыхание загрязненных частиц может вызвать серьезные проблемы, например сердечный приступ.Симптомы включают:

  • Боль или стеснение в груди
  • Учащенное сердцебиение
  • Задыхается
  • Усталость больше, чем обычно

Если у вас есть какие-либо из этих признаков, обратитесь к врачу. Обязательно сообщите своему врачу, если симптомы ухудшатся или длятся дольше обычного.

Защитите себя и свою семью

Хорошая новость в том, что вы можете многое сделать, чтобы защитить себя и свою семью от последствий для здоровья, вызванных загрязнением твердыми частицами. Начните с изучения Индекса качества воздуха Агентства по охране окружающей среды США (EPA).

Индекс качества воздуха (AQI)

Внешний значок индекса качества воздуха (AQI) Агентства по охране окружающей среды сообщает вам, когда загрязнение воздуха может достичь уровней, которые могут быть опасными. Вы можете использовать AQI как инструмент, который поможет вам избежать загрязнения частицами. Местные телеканалы, радиопрограммы и газеты сообщают об AQI. Попробуйте проверить его, когда будете планировать свои повседневные дела.

Принять меры

При высоком уровне загрязнения частицами примите меры по ограничению количества вдыхаемого воздуха на улице.Например:

  • Подумайте о том, чтобы проводить больше времени в помещении, где уровень загрязнения твердыми частицами обычно ниже.
  • Выбирайте более легкие занятия на свежем воздухе (например, ходьбу вместо бега), чтобы не дышать так тяжело.
  • Избегайте загруженных дорог и автомагистралей, где ТЧ обычно хуже из-за выбросов легковых и грузовых автомобилей.

Дополнительные инструменты, которые помогут вам узнать о качестве воздуха, см. На сайте «Отслеживание качества воздуха».

Начало страницы

Magnaflux EU EN

Ваша конфиденциальность

Когда вы посещаете веб-сайт, он может собирать информацию о вашем браузере, ваших предпочтениях или устройстве, чтобы веб-сайт работал так, как вы ожидаете.Эта информация собирается в виде файлов cookie. Собранная информация не идентифицирует вас напрямую, но может дать вам более персонализированный опыт работы с сайтом. Ниже описаны различные типы файлов cookie, которые мы используем, и вы можете запретить использование некоторых типов файлов cookie. Щелкните заголовок категории, чтобы узнать больше и изменить настройки файлов cookie по умолчанию. Обратите внимание, что блокировка некоторых типов файлов cookie может повлиять на работу вашего веб-сайта.

Совершенно необходимо

Эти файлы cookie необходимы для того, чтобы вы могли перемещаться по веб-сайту и использовать его функции. Без этих файлов cookie услуги веб-сайта, такие как запоминание товаров в корзине, не могут быть предоставлены. Мы не можем отключить эти файлы cookie в системе. Хотя вы можете настроить свой браузер так, чтобы он блокировал или предупреждал вас об этих файлах cookie, некоторые части веб-сайта не будут работать без них.

Модулей:

Производительность

Эти файлы cookie собирают анонимную информацию о том, как люди используют веб-сайт: посещения веб-сайта, источники трафика, шаблоны кликов и аналогичные показатели.Они помогают нам понять, какие страницы наиболее популярны. Вся собранная информация агрегирована и поэтому анонимна. Если вы не разрешите использование этих файлов cookie, мы не узнаем, когда вы посетили наш веб-сайт.

Модулей:

Функциональный

Эти файлы cookie запоминают сделанный вами выбор, например страну, из которой вы посещаете веб-сайт, язык и т. д.Они могут быть установлены нами или сторонними поставщиками, услуги которых мы добавили на страницы нашего веб-сайта. Если вы не разрешите использование этих файлов cookie, некоторые функции могут работать не так, как задумано.

Модулей:

Таргетинг / реклама

Эти файлы cookie собирают информацию о ваших привычках просмотра, чтобы сделать рекламу более актуальной для вас и ваших интересов. Они создаются через наших рекламных партнеров, которые учитывают ваши интересы и нацеливают вас на релевантную рекламу на других веб-сайтах или платформах.Если вы не разрешите использование этих файлов cookie, вы не увидите нашу таргетированную рекламу в других местах в Интернете.

Модулей: Икс
ASP.NET Framework

Технологический стек, необходимый для хостинга веб-сайта

Икс
Диспетчер тегов Google

Используется для загрузки скриптов на страницы сайта.

Икс
Google Analytics

Google Analytics собирает информацию о веб-сайтах, позволяя нам понять, как вы взаимодействуете с нашим веб-сайтом, и, в конечном итоге, обеспечить лучший опыт.

Имя файла cookie:

  • _ga

    Регистрирует уникальный идентификатор, который используется для генерации статистических данных о том, как посетитель использует веб-сайт.
    Срок действия: 2

    лет
  • _gid

    Регистрирует уникальный идентификатор, который используется для генерации статистических данных о том, как посетитель использует веб-сайт.
    Срок действия: 24 часы

  • NID

    Cookie содержит уникальный идентификатор, который Google использует для запоминания ваших предпочтений и другой информации, например, предпочитаемого вами языка (например. грамм. Английский), сколько результатов поиска вы хотите отображать на странице (например, 10 или 20) и хотите ли вы, чтобы фильтр безопасного поиска Google был включен.
    Срок действия: 2

    лет
  • _gat_UA — ######## — #

    Используется для ограничения частоты запросов. Если Google Analytics развернут через Диспетчер тегов Google, этот файл cookie будет называться _dc_gtm_
    Expiration: 1 минута

  • _gac_ <идентификатор-свойства>

    Содержит информацию о кампании для пользователя.Если вы связали свои учетные записи Google Analytics и AdWords, теги конверсии веб-сайта AdWords будут считывать этот файл cookie, если вы не отключите их.
    Срок действия: 90 дней

  • AMP_TOKEN

    Содержит токен, который можно использовать для получения идентификатора клиента из службы идентификатора клиента AMP. Другие возможные значения указывают на отказ, запрос в полете или ошибку при получении идентификатора клиента из службы идентификаторов клиентов AMP
    Срок действия: 1 год

Икс
Titan Consent Manager

Используется для отслеживания настроек конфиденциальности и согласия конечных пользователей на веб-сайтах, размещенных на Titan CMS.

Имя файла cookie:

  • TitanClientID

    Однозначно идентифицирует пользователя для поддержки исторического отслеживания предпочтений согласия
    Истечение срока: 10

    лет
  • CookieConsent_

    Отражает самые последние настройки согласия для текущего сайта.
    Срок действия: 2

    лет
Икс
Поиск IP

Эти файлы cookie используются Magnaflux для направления пользователей на веб-сайт Magnaflux для их конкретной страны. Это делается автоматически.

Икс
Пардо

Для наших веб-сайтов, которые содержат веб-формы или отслеживание Pardot, мы собираем информацию о страницах, которые вы посещаете, о том, как долго вы находитесь на сайте, как вы сюда попали и на что нажимаете.Pardot помогает Magnaflux обеспечить беспроблемный пользовательский интерфейс для тех клиентов и пользователей, которые создали у нас учетную запись для получения сообщений электронной почты.

Имя файла cookie:

  • visitor_id #

    Однозначно идентифицирует пользователя
    Срок действия: 10

    лет
  • visitor_id # -HASH

    Однозначно идентифицирует пользователя
    Срок действия: 10

    лет
  • pi_opt_in

    Флаг согласия на получение личной информации
    Истечение срока: 10

    лет
  • ИПВ

    Неклассифицированный
    Срок действия: Сессия

  • Пардо

    Неклассифицированный
    Срок действия: Сессия

  • dtCookie

    Неклассифицированный
    Срок действия: Сессия

Икс
Поисковые запросы

Для наших веб-сайтов, которые содержат поисковые запросы по пакету переводов, мы устанавливаем файл cookie, в котором хранится используемый поисковый запрос.

Икс
Отслеживание Google AdSense

Google использует файлы cookie для обслуживания рекламы, отображаемой на веб-сайтах своих партнеров, таких как веб-сайты, показывающие рекламу Google или участвующие в рекламных сетях, сертифицированных Google. Когда пользователи посещают веб-сайт партнера Google, в браузере этого конечного пользователя может быть сохранен файл cookie.

Имя файла cookie:

  • IDE

    Используется Google для регистрации и сообщения о действиях пользователя веб-сайта после просмотра или нажатия одной из рекламных объявлений рекламодателя с целью измерения эффективности рекламы и представления целевой рекламы пользователю.
    Срок действия: 6 мес

  • NID

    Неклассифицированный
    Срок действия: 6 мес

  • DSID

    Неклассифицированный
    Срок действия: Сессия

Икс
Отслеживание Google AdSense

Собирает данные для измерения эффективности просмотренных или нажатых объявлений и показывает таргетированные объявления.

Имя файла cookie:

  • г / сбор

    Неклассифицированный
    Срок действия: 6 мес

  • IDE

    Используется Google DoubleClick для регистрации и сообщения о действиях пользователя веб-сайта после просмотра или нажатия на одно из объявлений рекламодателя с целью измерения эффективности объявления и представления пользователю целевой рекламы.
    Срок действия: 1 год

  • test_cookie

    Используется для проверки, поддерживает ли браузер пользователя файлы cookie.
    Срок действия: Сессия

Икс
Аутентификация Titan CMS

Технологический стек, необходимый для хостинга веб-сайта

Произошла ошибка при настройке пользовательского файла cookie

Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности. Если ваш браузер не принимает файлы cookie, вы не можете просматривать этот сайт.


Настройка вашего браузера для приема файлов cookie

Существует множество причин, по которым cookie не может быть установлен правильно. Ниже приведены наиболее частые причины:

  • В вашем браузере отключены файлы cookie. Вам необходимо сбросить настройки своего браузера, чтобы он принимал файлы cookie, или чтобы спросить вас, хотите ли вы принимать файлы cookie.
  • Ваш браузер спрашивает вас, хотите ли вы принимать файлы cookie, и вы отказались.Чтобы принять файлы cookie с этого сайта, нажмите кнопку «Назад» и примите файлы cookie.
  • Ваш браузер не поддерживает файлы cookie. Если вы подозреваете это, попробуйте другой браузер.
  • Дата на вашем компьютере в прошлом. Если часы вашего компьютера показывают дату до 1 января 1970 г., браузер автоматически забудет файл cookie. Чтобы исправить это, установите правильное время и дату на своем компьютере.
  • Вы установили приложение, которое отслеживает или блокирует установку файлов cookie.Вы должны отключить приложение при входе в систему или проконсультироваться с системным администратором.

Почему этому сайту требуются файлы cookie?

Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности, запоминая, что вы вошли в систему, когда переходите со страницы на страницу. Чтобы предоставить доступ без файлов cookie потребует, чтобы сайт создавал новый сеанс для каждой посещаемой страницы, что замедляет работу системы до неприемлемого уровня.


Что сохраняется в файле cookie?

Этот сайт не хранит ничего, кроме автоматически сгенерированного идентификатора сеанса в cookie; никакая другая информация не фиксируется.

Как правило, в файлах cookie может храниться только информация, которую вы предоставляете, или выбор, который вы делаете при посещении веб-сайта. Например, сайт не может определить ваше имя электронной почты, пока вы не введете его. Разрешение веб-сайту создавать файлы cookie не дает этому или любому другому сайту доступа к остальной части вашего компьютера, и только сайт, который создал файл cookie, может его прочитать.

Счетчики жидких частиц — Системы измерения частиц

Только системы измерения частиц имеют лучшую в отрасли чувствительность 20 нм.

Будь то производство полупроводников, авиации, фармацевтики или чувствительных компонентов, контроль чистоты как воздуха, так и жидкости является требованием для поддержания высокого качества продукции с максимальным выходом. Компания Particle Measuring Systems производит оборудование для измерения частиц в соответствии с высочайшими отраслевыми стандартами и особенно подходит для обеспечения точного контроля в чистых помещениях.

Наши ведущие в отрасли счетчики жидких частиц обеспечивают надежный подсчет частиц в воде DI и UPW, а также в химикатах до 20 нм. Выберите из множества диапазонов чувствительности и среды, чтобы найти правильное решение для вашего приложения.

Счетчики жидких частиц необходимы для критического измерения сверхчистой воды и технологических химикатов в полупроводниковой и других отраслях обрабатывающей промышленности. Будь то производство полупроводников, авиации, фармацевтики или чувствительных компонентов — мониторинг загрязнения как в воздухе, так и в жидкости является требованием для поддержания высокого качества продукции с максимальным выходом. Системы измерения частиц (PMS) производят оборудование для контроля частиц, отвечающее самым высоким отраслевым стандартам, и особенно подходит для обеспечения точного контроля в чистых помещениях.

Счетчик частиц обнаруживает физические частицы, присутствующие как в сверхчистой воде, так и в технологических химикатах высокой чистоты. Контроль загрязнения в этих критических жидких технологических потоках имеет важное значение для повышения урожайности. Счетчики критических жидких частиц необходимы для разработки чистых химических и водных систем, а также для поддержания этих систем в чистой производственной среде.

Счетчики частиц

могут применяться в различных областях, связанных с чистыми средами. Наши счетчики жидких частиц могут определять размер, количество и природу частиц в жидких подложках, компьютерных компонентах, медицинских устройствах, чувствительном оборудовании или ряде других прецизионных устройств.Системы подсчета жидких частиц также могут определять общее качество жидкого субстрата; как количество, так и размер твердых частиц важны для определения чистоты чистящих растворов, жидких фармацевтических продуктов, пищевых продуктов, масел, топлива и смазочных материалов или различных других систем, в которых необходимо предотвратить загрязнение.

Счетчики жидких частиц используются в различных областях чистого производства. В сочетании с нашей глобальной командой экспертов по применению мы можем помочь вам контролировать загрязнение в различных областях и местах, включая:

  • встроенный контроль жидких частиц
  • Обеспечение химического качества в системах распределения, доставки или упаковки
  • отбор проб из партии химикатов
  • Контроль точки процесса
  • Проверка работоспособности компонентов для работы с химическими веществами
  • Количественное определение концентрации частиц в современных системах сверхчистой воды (UPW)
  • Анализ тенденций
  • Обнаружение роста бактерий в системах UPW
  • Отслеживание эпизодических событий и сигнализация
  • Непрерывный мониторинг системы
  • Управление производственным процессом
  • Иммерсионная литография
  • Измерение уровня частиц в шипучих жидкостях
  • Контроль процесса ванн для очистки пластин
  • Отбор проб емкостей для очистки деталей
  • Фармацевтический парентеральный мониторинг U. Стандарты S., EP, JP и FDA
  • Проверка чистоты деталей / медицинского оборудования
  • Лабораторный отбор проб воды для анализа очищенной воды и воды для инъекций (WFI)
  • Проверка эффективности фильтра

Наши ведущие в отрасли счетчики жидких частиц обеспечивают надежный подсчет частиц в воде DI и UPW, а также в химикатах до 20 нм. Выберите из множества диапазонов чувствительности и среды, чтобы найти правильное решение для вашего приложения.

Без эффективного измерения загрязнения невозможно надлежащий контроль жидких процессов.Системы измерения частиц (PMS) стремятся установить отраслевой стандарт для технологии мониторинга частиц, обеспечивая беспрецедентный контроль, качество и надежность нашего оборудования для чистых помещений.

Позвоните нам сегодня
Без надлежащих измерений надлежащий контроль за состоянием чистых помещений невозможен. Системы измерения частиц (PMS) стремятся установить отраслевой стандарт для технологий чистых помещений, гарантируя беспрецедентный контроль, качество и надежность нашего оборудования для чистых помещений.

Чтобы узнать больше о том, как PMS может обеспечить инновации, расширение возможностей и целостность средств управления чистыми помещениями, посетите наши предстоящие веб-семинары, зарегистрируйтесь в колледже частиц или свяжитесь с одним из наших местных офисов.

Вдыхаемые твердые частицы и здоровье (PM2,5 и PM10)

Что такое твердые частицы?

Переносимые по воздуху твердые частицы (ТЧ) не являются отдельным загрязнителем, а представляют собой смесь многих химических веществ. Это сложная смесь твердых частиц и аэрозолей, состоящая из мелких капель жидкости, сухих твердых фрагментов и твердых ядер с жидкими покрытиями.Частицы сильно различаются по размеру, форме и химическому составу и могут содержать неорганические ионы, соединения металлов, элементарный углерод, органические соединения и соединения земной коры. В целях регулирования качества воздуха частицы определяются по их диаметру. Те, что имеют диаметр 10 микрон или меньше (PM10), попадают в легкие и могут вызывать неблагоприятные последствия для здоровья. Мелкие твердые частицы определяются как частицы диаметром 2,5 микрона или менее (PM2,5). Следовательно, PM2,5 включает часть PM10.

В чем разница между PM10 и PM2,5?

PM10 и PM2,5 часто образуются из разных источников выбросов, а также имеют разный химический состав. Выбросы от сжигания бензина, масла, дизельного топлива или древесины производят большую часть загрязнения PM2,5, обнаруженного в наружном воздухе, а также значительную долю PM10. PM10 также включает пыль со строительных площадок, свалок и сельского хозяйства, лесные пожары и сжигание кустарников / мусора, промышленные источники, переносимую ветром пыль с открытых земель, пыльцу и фрагменты бактерий.

ТЧ могут либо напрямую выбрасываться из источников (первичные частицы), либо образовываться в атмосфере в результате химических реакций газов (вторичных частиц), таких как диоксид серы (SO 2 ), оксиды азота (NO X ) и некоторые органические соединения. Эти органические соединения могут выделяться как из естественных источников, таких как деревья и растительность, так и из искусственных (антропогенных) источников, таких как промышленные процессы и выхлопные газы транспортных средств. Относительные размеры PM10 и PM2.5 частиц сравниваются на рисунке ниже.

Почему CARB беспокоятся о PM10 и PM2,5?

CARB обеспокоен переносимыми по воздуху частицами из-за их воздействия на здоровье жителей Калифорнии и окружающую среду. И PM2,5, и PM10 можно вдыхать, при этом некоторое их количество откладывается в дыхательных путях, хотя места отложения частиц в легких зависят от размера частиц. PM2,5 с большей вероятностью попадет и откладывается на поверхности более глубоких частей легкого, в то время как PM10 с большей вероятностью откладывается на поверхности более крупных дыхательных путей верхней части легкого.Частицы, осевшие на поверхности легких, могут вызывать повреждение тканей и воспаление легких.

Какие виды вредных воздействий могут вызывать твердые частицы?

Ряд неблагоприятных воздействий на здоровье был связан с воздействием как PM2,5, так и PM10. Кратковременное воздействие PM2,5 (продолжительностью до 24 часов) было связано с преждевременной смертностью, увеличением количества госпитализаций по причинам, связанным с сердцем или легкими, острым и хроническим бронхитом, приступами астмы, посещениями пунктов неотложной помощи, респираторными симптомами и ограничениями. дни активности.Об этих неблагоприятных последствиях для здоровья сообщалось в основном у младенцев, детей и пожилых людей с ранее существовавшими заболеваниями сердца или легких. Кроме того, из всех распространенных загрязнителей воздуха PM2,5 связаны с наибольшей долей неблагоприятных последствий для здоровья, связанных с загрязнением воздуха, как в Соединенных Штатах, так и во всем мире, согласно проекту Всемирной организации здравоохранения «Глобальное бремя болезней».

Кратковременное воздействие PM10 было связано в первую очередь с обострением респираторных заболеваний, включая астму и хроническую обструктивную болезнь легких (ХОБЛ), что привело к госпитализации и обращению в отделения неотложной помощи.

Долгосрочное (от месяцев до лет) воздействие PM2,5 было связано с преждевременной смертью, особенно у людей с хроническими заболеваниями сердца или легких, а также с замедлением роста функции легких у детей. Последствия длительного воздействия PM10 менее очевидны, хотя несколько исследований предполагают связь между долгосрочным воздействием PM10 и респираторной смертностью. Международное агентство по изучению рака (IARC) опубликовало в 2015 году обзор, в котором сделан вывод о том, что твердые частицы в загрязненном атмосферном воздухе вызывают рак легких.

Diesel PM : Особый класс твердых частиц. Твердый материал в выхлопе дизельного двигателя известен как твердые частицы дизельного топлива (DPM). Более 90% DPM имеет диаметр менее 1 мкм (примерно 1/70 диаметра человеческого волоса) и, таким образом, является подмножеством PM2,5. Дополнительная информация

Кто подвергается наибольшему риску от воздействия твердых частиц?

Исследования указывают на пожилых людей с хроническими заболеваниями сердца или легких, детей и астматиков как на группы, наиболее подверженные неблагоприятным последствиям для здоровья от воздействия PM10 и PM2.5. Кроме того, дети и младенцы подвержены вреду от вдыхания загрязнителей, таких как ТЧ, потому что они вдыхают больше воздуха на фунт веса тела, чем взрослые — они дышат быстрее, проводят больше времени на открытом воздухе и имеют меньшие размеры тела. Кроме того, незрелая иммунная система детей может сделать их более восприимчивыми к PM, чем здоровые взрослые.

Исследования, проведенные в рамках исследования здоровья детей, инициированного CARB, показали, что у детей, живущих в сообществах с высоким уровнем PM2,5, рост легких был медленнее, а легкие в возрасте 18 лет меньше, чем у детей, живущих в сообществах с низким уровнем PM2.5 уровней.

CARB использовал методологию оценки рисков Агентства по охране окружающей среды США для оценки преждевременной смертности, связанной с воздействием PM2,5 (California Air Resources Board 2010). Обновление этого анализа с использованием данных о качестве атмосферного воздуха за 2014–2016 годы показало, что воздействие PM2,5 приводит к 5400 (диапазон неопределенности 4200–6700) преждевременных смертей от сердечно-легочных причин в год в Калифорнии. Кроме того, PM2,5 способствует примерно 2800 госпитализациям по поводу сердечно-сосудистых и респираторных заболеваний (диапазон неопределенности 350–5100) и около 6700 обращений в отделения неотложной помощи по поводу астмы (диапазон неопределенности 4200–9300) каждый год в Калифорнии.

Как твердые частицы влияют на окружающую среду?

Во многих научных исследованиях было показано, что твердые частицы снижают видимость, а также отрицательно влияют на климат, экосистемы и материалы. ТЧ, в первую очередь ТЧ2,5, влияют на видимость, изменяя способ поглощения и рассеяния света в атмосфере. Что касается изменения климата, то некоторые компоненты окружающей смеси ТЧ способствуют потеплению климата (например, черный углерод), в то время как другие оказывают охлаждающее влияние (например.g., нитрат и сульфат), и поэтому атмосферные ТЧ обладают свойствами как для потепления климата, так и для охлаждения. ТЧ могут отрицательно влиять на экосистемы, включая растения, почву и воду из-за осаждения ТЧ и их последующего поглощения растениями или отложения в воду, где они могут повлиять на качество и прозрачность воды. Металлы и органические соединения в ТЧ обладают наибольшим потенциалом для изменения роста и урожайности растений. Осаждение ТЧ на поверхности приводит к загрязнению материалов.

Являются ли твердые частицы проблемой в помещении?

Некоторые твердые частицы, обнаруженные в помещении, образуются снаружи, особенно PM2.5. Эти частицы проникают в помещения через двери, окна и «протечки» в строительных конструкциях. Частицы также могут происходить из внутренних источников. Частицы внутреннего происхождения включают компоненты, полученные из биологических источников, многие из которых являются известными аллергенами, например пыльца, споры плесени, пылевые клещи и тараканы. Частицы также образуются в помещениях, включая курение табака, приготовление пищи и сжигание дров, свечей или благовоний. Частицы также могут образовываться в помещении в результате сложных реакций газообразных загрязнителей, выбрасываемых из таких источников, как бытовые чистящие средства и освежители воздуха.

Каковы стандарты качества окружающего воздуха для твердых частиц?

Стандарты качества окружающего воздуха определяют максимальное количество загрязняющих веществ, которые могут присутствовать в наружном воздухе без вреда для здоровья человека. В 2002 году, после обширного обзора научной литературы, Совет принял новый среднегодовой стандарт для PM2,5 ppm и сохранил существующие годовые и 24-часовые стандартные средние стандарты для PM10. Национальный ежегодный стандарт PM2,5 был в последний раз пересмотрен в 2012 году после исчерпывающего обзора новой литературы, указывающей на доказательства повышенного риска преждевременной смертности при более низких PM2.5 концентраций по сравнению с существующим стандартом. Обзор 2012 года привел к сохранению существующих суточных средних стандартов PM2,5 и PM10.

PM2,5 PM10
Среднегодовое значение Среднее значение за 24 часа Среднегодовое значение за 24 часа Национальный стандарт качества окружающего воздуха 12 мкг / м 3 35 мкг / м 3 Нет 150 мкг / м 3
Калифорния Стандарт качества окружающего воздуха 9044 12 мкг / м 3 Нет 20 мкг / м 3 50 мкг / м 3

Тонущие частицы способствуют вертикальной связи в океаническом микробиоме. живая биомасса и биологическое разнообразие океана, одной из крупнейших экосистем на Земле.Погружение частиц в воду — это широко распространенный механизм, который переносит материалы в глубины океана, играющий важную роль в глобальном углеродном цикле. Является ли этот процесс глобальным путем распространения прокариотического разнообразия, соединяющего поверхностные сообщества с сообществами в темном океане, никогда не проверялось. Здесь мы показываем, что поверхностные и глубоководные сообщества прокариот тесно связаны, составляя обширное океаническое метасообщество, где местные сообщества связаны посредством переноса тонущих частиц.Это вертикальное рассредоточение, опосредованное в основном крупнейшими тонущими частицами, является фундаментальным процессом, формирующим сборку и биогеографию глубоководных океанических прокариотических сообществ.

Abstract

Погружение органических частиц, образующихся в фотическом слое, является основным вектором экспорта углерода в глубины океана. Хотя тонущие частицы сильно колонизированы микробами, до сих пор не изучалось, играет ли этот процесс роль в переносе прокариотического разнообразия с поверхности в глубинные слои океана.Используя секвенирование гена 16S рРНК Illumina, мы исследуем здесь вертикальную связность микробиома океана, охарактеризовав морские прокариотические сообщества, связанные с пятью фракциями разного размера, и изучив их композиционную изменчивость от поверхности до 4000 м на восьми станциях, отобранных в Атлантическом и Тихоокеанском регионах. и Индийские океаны во время экспедиции на Маласпина 2010. Наши результаты показывают, что самые многочисленные прокариоты в глубинах океана также присутствуют в поверхностных водах.Эта вертикальная связь сообществ, по-видимому, происходит преимущественно через самые большие частицы, потому что сообщества в фракциях самого большого размера показали самое высокое таксономическое сходство по всей толще воды, тогда как свободноживущие сообщества были более изолированы по вертикали. Наши результаты также предполагают, что процессы колонизации частицами, происходящие в поверхностных водах, в некоторой степени определяют состав и биогеографию батипелагических сообществ. В целом, мы постулируем, что тонущие частицы действуют как векторы, которые инокулируют жизнеспособные поверхностные микробы, прикрепленные к частицам, в глубоководную область, определяя в значительной степени структуру, функционирование и биогеографию глубоководных океанических сообществ.

Значительная часть органического углерода, образующегося на поверхности залитого солнцем океана в результате фотосинтеза, экспортируется в глубину океана в виде тонущих частиц (1, 2), поддерживая глобально значимый поток углерода, питающий обычно голодающие сообщества батипелагических микробов (3, 4) . Хотя углерод, достигающий темного океана, в конечном итоге контролируется активностью прокариотических сообществ, которые прикрепляются к этим частицам (5, 6), до сих пор ни одно исследование не исследовало, могут ли тонущие частицы также представлять собой векторы рассеивания жизнеспособного прокариотического разнообразия в глубинах океана. .

Частицы, образующиеся в поверхностных водах, быстро колонизируются прокариотами, и прикрепленные к частицам сообщества часто более метаболически активны (7⇓ – 9) и филогенетически разнообразны (например, ссылки 10⇓ – 12), чем взвешенные (свободноживущие) сообщества. . Хотя было показано, что связанные с частицами прокариотические сообщества меняются составом с глубиной (например, ссылки 13–15), неясно, являются ли эти изменения следствием экологической сукцессии таксонов на деградирующей частице (16) или непрерывной колонизация частиц во время погружения.Сборки, прикрепленные к тонущим частицам, могут влиять на структуру более глубоких прокариотических сообществ, если спящие или медленно растущие поверхностные таксоны процветают при достижении определенной глубины или при изменении природы частицы. В этом случае тонущие частицы обеспечат непрерывный приток жизнеспособных иммигрантов в глубокие океаны.

Оценка значимости такого процесса расселения потребовала бы сравнения сообществ, связанных с частицами, между поверхностными и батипелагическими водами, но это никогда не предпринималось, даже в локальных масштабах.В самом деле, вертикальная связь между сообществами от поверхности до батипелагических вод остается плохо изученной, потому что пространственные исследования, фокусирующиеся в вертикальном измерении, часто описывают сообщества с каждой глубины без оценки их потенциальных связей по всей толще воды (например, ссылки 17⇓ – 19). Только несколько недавних исследований показали, что сообщества из поверхностных и глубоких вод могут быть связаны посредством адвекции или опускания водных масс (20⇓ – 22), но они не учитывали роль опускающихся частиц как вектора, поддерживающего вертикальную связность.Кроме того, поскольку крупные частицы опускаются быстрее, чем мелкие частицы, которые могут даже оставаться плавучими (23⇓ – 25), сообщества, связанные с более крупными и быстро опускающимися частицами, вероятно, будут иметь больше шансов достичь самых глубоких слоев из-за более высоких скоростей рассеивания. Однако до настоящего времени большая часть литературы по прокариотам с прикрепленными частицами ограничивалась дихотомическим исследованием свободноживущих и прикрепленных популяций (например, ссылки 26–28), однако известно, что частицы встречаются в континууме размеров, которые могут быть колонизированы различными микробными популяциями (29).Кроме того, этот континуум размеров тесно связан с составом частицы, что также указывает на происхождение частицы: более крупные частицы моложе и более лабильны и образуются на поверхности (30), тогда как более мелкие частицы имеют тенденцию быть более старыми и устойчивыми. (31), возникающие в результате деградации более крупных частиц (32).

Учитывая, что происхождение и состав частиц в поверхностных водах различаются в пространстве (25, 33⇓ – 35), можно предположить, что структура микробного разнообразия в глубоком океаническом зеркале в некоторой степени связана с неоднородностью поверхности.Фактически, недавно было показано, что глубоководные сообщества, связанные с частицами, представляют гораздо более четкую биогеографию, чем их свободноживущие аналоги (36), но остаются ли эти закономерности локальными в глубоком море или переносятся с поверхности через тонущие частицы, остается неизученным. . Хотя важность гидрологически опосредованного распространения микробов для формирования местных сообществ была четко продемонстрирована в пресноводных экосистемах (37–39), а в последнее время и в океанических водах через движение водных масс (20–22, 40), роль частиц -зависимая вертикальная дисперсия в объяснении биогеографических структур глубоководных прокариот еще не была оценена.

Здесь мы исследуем, представляют ли тонущие частицы вектор распространения прокариот в глубинах океана, способствуя вертикальной связности морского микробиома, и проверяем гипотезу о том, что размер частиц влияет на вертикальную связность. Мы исследовали состав свободноживущих прокариотических сообществ, а также тех, которые прикреплены к частицам разного размера (от 0,8 до 200 мкм) на восьми станциях в глобальном тропическом и субтропическом океане, оценивая изменения в их составе с поверхности (3 м) до батипелагических вод (4000 м).В частности, мы проверяем гипотезу о том, что сообщества, прикрепленные к самым крупным частицам, демонстрируют сильное вертикальное сходство из-за предполагаемых более высоких скоростей опускания (т. Е. Более высокого рассредоточения) и что свободноживущие сообщества прокариот более различаются в толще воды, чем их вертикально связанные частицы. -прилагаемые аналоги. Более того, если часть тонущего разнообразия отделяется от частиц при достижении батипелагического слоя, становясь, таким образом, частью свободноживущего сообщества, процент прокариот, прикрепленных к частицам в поверхностных водах, также должен присутствовать как свободноживущие в батипелагическом слое. сообщества.Наконец, мы проверяем гипотезу о том, что если вертикальная связность является глобально значимым явлением, то глубоководные биогеографические модели должны напоминать модели сообществ, связанных с поверхностными частицами.

Результаты

Таксономический состав прокариотических сборок.

Мы исследовали станции, охватывающие широкий продольный градиент через тропический и субтропический Тихий, Атлантический и Индийский океаны ( SI Приложение , рис. S1 A ). Глубины, отобранные в пределах каждой станции, имели ярко выраженные вертикальные физико-химические и биологические вариации ( SI Приложение , рис.S1 B ). Соответственно, изученные прокариотические сообщества были четко структурированы вдоль водной толщи, различаясь в основном между фотической и афотической сферами, и имели также различные биогеографические признаки (рис.1 B и C и SI Приложение , таблица S1). . В то время как сообщества из самых крупных частиц (≥3,0 мкм) сгруппировались вместе независимо от глубины, сообщества из двух самых маленьких фракций сильно различались между поверхностными и более глубокими слоями (рис.1 A и B ). Следовательно, вертикальные различия сообществ были выше для фракции наименьшего размера (PERMANOVA R 2 = 0,37, P <0,001), чем для фракций наибольшего размера ( R 2 = 0,09, P = 0,597 ) ( SI Приложение , Таблица S2), тогда как горизонтальные различия, то есть между станциями, были выше в фракциях наибольшего размера ( R 2 = 0,54, P <0.001), чем во фракции наименьшего размера ( R 2 = 0,21, P <0,753) ( SI Приложение , Таблица S2). Как показывает RC Bray (метрика Раупа-Крика, основанная на расстояниях Брея-Кертиса), наблюдаемые модели бета-разнообразия значительно отличались от ожидаемых случайно (т. Е. Экологический дрейф) примерно в 92% случаев [согласно Stegen et al. (41)], и это предполагает, что наблюдаемые паттерны бета-разнообразия генерировались другими процессами (такими как отбор и ограниченное или сильное рассредоточение), а не случайной сборкой сообщества (дрейфом).

Рис. 1.

ординации nMDS, представляющие пространственно расстояния Брея – Кертиса между изученными прокариотическими сообществами. Расстояния рассчитывались по разреженной таблице OTU. Образцы имеют цветовую кодировку в зависимости от фракции ( A ), глубины ( B ) и станции отбора проб ( C ).

Богатство операционных таксономических единиц (OTU) сильно варьировалось в зависимости от фракций размера и глубины (диапазон 136–1044 OTU на выборку, в среднем 580), но в целом богатство уменьшалось в сторону более крупных фракций на всех глубинах ( SI Приложение , рис. .S2). Что касается таксономического состава на уровне типа или класса, три фракции размером более 3,0 мкм в целом были более похожи друг на друга, чем фракции самого мелкого размера ( SI Приложение , рис. S3). Распределение значений индекса ниши ассоциации частиц (PAN-Index), используемых для определения предпочтений OTU для определенных фракций размера, показало два режима около значений 1,5 и 3,5 ( SI Приложение , рис. S4). Поэтому мы дифференцировали ОТЕ, обогащенные фракциями небольшого размера (PAN-Index <2.7) из обогащенных крупными фракциями (PAN-индекс ≥ 2.7). Мы обнаружили, что предпочтение того или иного образа жизни, по-видимому, филогенетически сохраняется на уровне порядка (но в некоторых случаях не на уровне класса или типа). В то время как некоторые отряды, такие как SAR11, SAR324 или Acidimicrobiales, отдавали предпочтение фракциям небольшого размера, другие отряды, такие как Rhizobiales, Alteromonadales или Planctomycetales, предпочтительно были обогащены фракциями большого размера (PAN-индексы ≥ 2.7; SI Приложение , рис.S5).

Вертикальная связь между океаническими прокариотическими сообществами.

Чтобы определить вертикальную связь между прокариотическими сообществами, мы исследовали, могут ли OTU, присутствующие на одной глубине, быть обнаружены на других глубинах. Для этого все OTU были разделены на четыре группы по глубине: поверхностные (SFC), глубинные максимумы хлорофилла (DCM), мезопелагические (MESO) и батипелагические (BATHY), определяемые глубиной, на которой они были впервые обнаружены, с учетом направленности. от поверхности до батипелагических вод с учетом всех станций вместе.Например, если OTU был обнаружен в любом из образцов поверхности, он был отнесен к категории SFC, но если OTU был впервые обнаружен в мезопелагических водах, но не на предыдущих глубинах (на поверхности и DCM), он был отнесен к категории MESO, и скоро. Для этой категоризации использовалась нерассмотренная таблица OTU, чтобы мы могли обнаружить наибольшее количество OTU на выборку. Этот анализ показал, что даже несмотря на то, что новые OTU непрерывно появлялись при перемещении с одной глубины на другую (рис. 2), в сообществах со всех глубин и всех размерных фракций в значительной степени преобладали OTU, присутствующие в поверхностных водах (SFC OTU).Когда эта категоризация ОТЕ проводилась с учетом каждой станции отдельно, мы наблюдали аналогичную картину, но на некоторых станциях был больший вклад ОТЕ, не присутствующих в поверхностных водах в глубоких слоях, особенно в свободноживущей фракции ( SI Приложение , рис. S6). Это указывает на то, что некоторые из DCM, MESO или BATHY OTU на некоторых станциях не присутствовали на поверхности этих конкретных станций, но присутствовали в поверхностных водах на других участках. В любом случае в батипелагических сообществах всех станций численно преобладали поверхностные последовательности, что указывает на высокую вертикальную взаимосвязь микробных сообществ открытого океана.Это означает, что изменения сообществ по глубине (рис. 1 B ) в значительной степени связаны с сдвигами в относительной численности таксонов, присутствующих в водной толще (например, редкие поверхностные таксоны, которые становятся многочисленными в более глубоких слоях).

Рис. 2.

Вклад ОТЕ, классифицированных как поверхностные (SFC), глубокие максимумы хлорофилла (DCM), мезопелагические (MESO) и батипелагические (BATHY), в каждой фракции глубины и размера, выраженной как ( A ) процент OTU и ( B ) процент последовательностей.Категория каждой OTU была определена как глубина, на которой они были впервые обнаружены, с учетом направления от поверхности к батипелагическим водам и рассмотрения всех станций вместе (подробности см. В Материалы и методы ).

Вертикальная дифференциация между сообществами данной размерной фракции постепенно изменялась от свободноживущих прокариотических сообществ к сообществам в самых крупных частицах (рис. 3), а различия между фракциями малого и большого размера были статистически значимыми (критерий Вилкоксона, P значение <0.001). Мы обнаружили наивысшее бета-разнообразие и оборот OTU среди глубин во фракции 0,2–0,8 мкм (рис. 3 A и B ), что указывает на более высокую замену OTU внутри свободноживущих сообществ на глубине по сравнению с сообществами, прикрепленными к самые большие частицы. И наоборот, сообщества из фракции самого большого размера показали более высокую степень вложенности (рис.3 C ), а OTU присутствовали на большей глубине (рис.3 D ) по сравнению с сообществами фракций меньшего размера, что позволяет предположить, что сообщества прикреплены к более крупным частицам. они более связаны в толще воды, чем свободноживущие или прикрепленные к мелким частицам.Затем мы разделили SFC OTU (т. Е. OTU, обнаруженные на любой из наземных станций; см. Выше) на те, которые обогащены фракциями небольшого размера (индекс PAN <2.7) и те, которые обогащены фракциями большого размера (индекс PAN ≥ 2.7) и сравнили их распределение вдоль водной толщи на мелкие (и взвешенные, т.е. <3,0 мкм) и большие (и опускающиеся, т.е. ≥3,0 мкм) фракции (рис. 4). Мы обнаружили, что поверхностные OTU, присутствующие в фракциях с наименьшим размером поверхности (SFC OTU с PAN-Index <2.7), объясняют уменьшение доли сообществ в сторону более глубоких вод в мелких фракциях взвешенных частиц (рис.4 A ) и составляли около 25% от численности в самых крупных фракциях вдоль водной толщи (рис. 4 B ). Напротив, большинство батипелагических сообществ состояло из ОТЕ, присутствующих на поверхности в ассоциации с крупными частицами (SFC OTU с PAN-индексом ≥ 2.7), которые составляли около 80% батипелагических толщ в самых крупных фракциях (Рис. 4 B ) и более 50% батипелагических толщ во взвешенных фракциях (рис. 4 A ). Это говорит о том, что глубоководные сообщества в значительной степени населены поверхностными микробами, прибывающими через самые крупные частицы, и что это расселение в основном влияет на сообщества, прикрепленные к батипелагическим частицам (рис.4 B ), но и глубоководные свободноживущие сообщества (рис. 4 A ). Колонизация свободно живущих батипелагических сообществ тонущими частицами также подтверждается наблюдением, что свободноживущие сообщества батипелагических более похожи на присоединенные сообщества батипелагических, чем любые другие сообщества (рис. 1). Напротив, свободноживущие сообщества на поверхности вносят гораздо меньший вклад в батипелагическое разнообразие, вероятно, из-за их более ограниченного вертикального расселения.

Рис. 3.

Вертикальное изменение бета-разнообразия ( A ) (т.е. дифференциация сообществ), ( B ) пространственный оборот OTU (т.е. замена видов), ( C ) вложенность (потеря видов) и ( D ) ширина ниши (т. Е. Специализация среды обитания OTU на основе количества глубин, на которой была обнаружена OTU) для каждой фракции размера. Значения были рассчитаны для глубин, для каждой фракции размера и отдельно для каждой станции. Коробчатые диаграммы суммируют данные с восьми станций.Бета-разнесение содержало значения от 1 до 4, где 1 указывает, что все OTU с четырех глубин одинаковы, а 4 указывает, что OTU с четырех глубин полностью различны. Бета-разнообразие можно разделить на две составляющие: текучесть и вложенность. Оборот указывает на замену одних OTU другими от глубины к глубине, а вложенность указывает подмножество OTU от одной глубины к другой. И текучесть, и вложенность имели значения от 0 до 1, что указывало на уровень вклада в бета-разнообразие.Ширина ниши рассчитывалась для каждой OTU, указывая количество глубин, на которых была обнаружена OTU. Значения варьировались от 1 до 4, где 4 указывает, что данная OTU присутствует на четырех глубинах (т. Е. Более высокие значения прямоугольной диаграммы указывают, что OTU заданной доли размера присутствовали на большей глубине). См. Материалы и методы для получения более подробной информации.

Рис. 4.

Вертикальная вариация вклада (в процентах от последовательностей) поверхностных ОТЕ, обогащенных мелкими фракциями (PAN-Index <2.7) (светло-серый) и поверхностных ОТЕ, обогащенных крупными фракциями (PAN-индекс ≥ 2.7) (темно-серый), до сообществ, присутствующих во фракциях ( A ) фракциях <3,0 мкм и ( B ) фракциях ≥3,0 мкм и при каждая глубина. Коробчатые диаграммы суммируют данные с восьми станций. См. Материалы и методы для получения дополнительной информации.

Перенос биогеографических закономерностей с поверхности в глубокое море.

Учитывая более высокий вертикальный перенос микробов, связанных с более крупными частицами, можно ожидать, что пространственные различия (т.е.е., различия между станциями) между сообществами из самых крупных частиц поддерживаются вертикально, тогда как ожидается, что взвешенные сообщества будут более изолированными по вертикали, и, таким образом, их поверхностные биогеографические структуры не будут перенесены на глубину. Мы проверили этот вывод, сравнив для каждой размерной фракции пространственные различия между поверхностными сообществами и мезопелагическими или батипелагическими сообществами, используя тесты Mantel (Таблица 1). Мы обнаружили, что различия между взвешенными сообществами с поверхности и мезопелагическими или батипелагическими водами существенно не коррелировали.Напротив, различия между сообществами, прикрепленными к частицам с поверхности и глубоководными водами, показали высокую значительную корреляцию (Таблица 1), предполагая, что различия в составе между станциями глубоководных сообществ, связанных с частицами, были вызваны, по крайней мере, частично биогеографическими данными. паттерны поверхностных ассоциаций, прикрепленных частицами.

Таблица 1.

Сравнение структуры сообществ между глубинами

Представленные результаты подтверждают гипотезу о том, что биогеография поверхностных прокариот, прикрепленных к частицам, переносится в более глубокие воды через опускание частиц, но тот факт, что сообщества из фотической и афотической сфер были очень значительными. разные по таксономическому составу ( SI Приложение , рис.S3) предполагает, что это вертикальное расселение прикрепленных к частицам микробов должно сопровождаться большими изменениями их численности во время погружения. Например, рост таксонов, которые были редкими (и, возможно, бездействующими) в поверхностных водах, но могут процветать на более глубоких глубинах, может объяснить такие изменения состава. На каждой станции мы определили OTU, которые потенциально могут расти во время опускания частиц, путем выбора поверхностных OTU, преобладающих в фракциях большего размера (SFC OTU с индексом PAN ≥ 2.7), относительная численность (преобладание) которых увеличивалась по направлению к более глубоким водам, названные здесь как « seed »ОТЕ (см. подробности в « Материалы и методы »).Мы идентифицировали в общей сложности 90 семенных OTU, которые составляли ~ 6% последовательностей на поверхности, и показали явное увеличение относительной численности к более глубоким водам до 55% (в среднем ~ 35%) от общей численности в батипелагических частицах, прикрепленных к ним. сообщества (рис. 5). Пул таксонов, ведущих себя как семена, различался между станциями, и на каждой станции были обнаружены разные доминирующие группы семян (например, Oceanospirillales доминируют на станции 20, Sphingobacteriales на станции 77 и Corynebacteriales на станции 94) (рис.5). Более того, когда мы исследовали структуру сообщества только этих исходных OTU, мы обнаружили, что они сгруппированы в соответствии с восемью станциями ( SI Приложение , рис. S7). Этот географический признак был менее ясен для фракций наименьшего размера (более мелкие символы) в некоторых случаях, но все же он указывает на высокую значимость процессов колонизации поверхностными частицами для определения структуры сообществ из более глубоких слоев.

Рис. 5.

Динамика ОТЕ семян на каждой станции и по глубине.Seed OTUs — это поверхностные OTU, обогащенные фракциями большего размера, относительная численность которых увеличивается с глубиной. Данные представляют вклад OTU, отнесенных к категории семян, в общие последовательности сообществ, связанных с фракциями наибольшего размера (≥3,0 мкм; подробности см. В Results ). Круговые диаграммы показывают таксономический состав на уровне порядка (в процентах последовательностей) исходных OTU на каждой станции. Обратите внимание на разные масштабы на графиках.

Обсуждение

Наши результаты подтверждают гипотезу о сильной опосредованной частицами прокариотической связи между поверхностью и глубинами океана, гипотезу, предложенную ранее (например,г., исх. 42 и 43) и протестированы здесь. Большинство доминирующих прокариот из глубоководных районов океана также можно обнаружить в поверхностных водах, и эта вертикальная связность выше в сообществах, связанных с фракциями большего размера (то есть с более крупными частицами), вероятно, из-за их более высокой скорости погружения. Наши результаты показывают, что опускание частиц представляет собой вектор распространения жизнеспособного микробного разнообразия из поверхностных вод в батипелагическую зону, что в конечном итоге определяет биогеографию глубоководных прокариот.Они также предполагают, что тонущие частицы действительно могут быть подходящим источником жизнеспособных таксонов для глубоководных океанов, в соответствии с предыдущими исследованиями, предполагающими существование океанического резервуара спящего разнообразия (44–46).

Хотя вертикальная дифференциация сообществ от фотических к афотическим царствам хорошо задокументирована (например, ссылки 47–49), мы показываем здесь, что это различие зависит от размера частиц и является наибольшим среди свободноживущих сообществ и прокариотических сообществ, связанных с самые мелкие фракции (рис.1 и SI Приложение , рис. S3 и таблица S1). Наши результаты также согласуются с предыдущими исследованиями, показывающими, что прокариотические сообщества сильно различаются между свободноживущими (взвешенными) и прикрепленными фракциями в эпипелагических (29, 43, 50), а также в батипелагических (10, 51, 52) водах, подтверждая наличие ниш. на частицах отличны от растворенной фазы. Другие показали, что состав более крупных частиц отличается от состава более мелких частиц (а также от растворенной фазы), причем более крупные частицы являются более молодыми и более лабильными, а более мелкие частицы являются более старыми и более стойкими (31, 32).

Вывод о том, что во всех сообществах, включая те, что населяют батипелагический слой, численно преобладали ОТЕ, присутствующие в поверхностных водах, подтверждает сильную вертикальную связь между поверхностными и батипелагическими сообществами на местном ( SI Приложение , рис. S6) и глобальном масштабе. (Рис. 2) шкалы. Учитывая изменчивость по глубине в структуре сообществ (рис. 1 и SI Приложение , рис. S3), вертикальные изменения в сообществах прокариот, вероятно, вызваны изменениями в относительной численности таксонов, присутствующих на нескольких глубинах во время погружения, я.е., редкие поверхностные таксоны, которые становятся многочисленными в более глубоких водах. Лишь несколько недавних исследований оценили вертикальную связность морских прокариотических сообществ вдоль водной толщи, указав, что адвекция и конвекция водных масс могут формировать структуру поверхностных и глубинных микробных сообществ, способствуя их переносу и колонизации новой среды обитания (20–22 ). Однако эти исследования были сосредоточены только на свободноживущих сообществах и процессах вертикального переноса водных масс как движущем механизме.Здесь мы приводим доказательства того, что вывоз тонущих частиц представляет собой важный путь распространения разнообразия от поверхностных до батипелагических вод. Хотя этот процесс можно рассматривать как однонаправленный от поверхности к глубоководным водам, что подтверждается свидетельствами быстрого опускания частиц с поверхности в глубину океана вдоль станций, отобранных экспедицией Маласпины (53), также возможно, что события апвеллинга глубинных вод — водные массы переносят жизнеспособных глубоководных прокариот обратно в поверхностные воды.Эта возможность должна быть проверена в будущих исследованиях в зонах апвеллинга.

Гипотеза о том, что вертикальная прокариотическая связность обусловлена ​​рассеянием таксонов от поверхности к более глубоким водам под действием тонущих частиц, дополнительно подтверждается наблюдением, что связность по всей вертикальной колонке выше для сообществ, связанных с самыми крупными частицами, чем для прикрепленных к меньшим, как и ожидалось из-за более быстрого опускания более крупных частиц (например, скорость опускания <1 м⋅д -1 для мелких частиц и> 1000 м⋅д -1 для крупных агрегатов, рассмотрено в исх.3). Например, состав сообщества фракций меньшего размера был более изменчивым между глубинами (т. Е. Более высокое бета-разнообразие), чем состав сообщества фракций самого большого размера (Рис. 3 A и SI Приложение , Таблица S2). Кроме того, наибольшее замещение (оборот) OTU по глубине было обнаружено между сообществами из мельчайших частиц, а OTU из сообществ, связанных с самыми крупными частицами, были наиболее распространенными по глубине (Рис. 3 C ). В целом это указывает на более интенсивное вертикальное рассредоточение таксонов между сообществами из фракций наибольшего размера, тогда как сообщества прокариот из фракций наименьшего размера имеют более ограниченное распределение по глубине, т.е.е., более изолированы по вертикали из-за их более ограниченной возможности подключения.

Кроме того, мы наблюдали, что ОТЕ с предпочтением крупных частиц в поверхностных водах также доминируют в мезопелагических и батипелагических сообществах (рис. 4). Тот факт, что глубинные сообщества в фракциях небольшого размера также в значительной степени состояли из прикрепленных к поверхности прокариот (рис. батипелагический слой по сравнению с любыми другими (рис.1), предполагает, что большие частицы действительно являются векторами, транспортирующими жизнеспособных прокариот с поверхности в батипелагическую среду, некоторые из которых могут процветать в свободноживущей части батипелагической области. Таким образом, перенос прокариот из поверхностных вод в глубокие воды происходит в основном с помощью крупных частиц, которые действуют как источник потенциальных иммигрантов (или инокулята) для взвешенного сообщества, живущего в глубоких океанских глубинах. Эти результаты согласуются с предыдущим исследованием, показывающим, что определенные таксоны могут менять свои предпочтения от крупных частиц к мелким по глубине (51), вероятно, в зависимости от условий окружающей среды.

Частицы имеют весьма неоднородный органический и неорганический состав, который изменяется во время погружения, но в основном определяется условиями окружающей среды поверхностных вод, в которых они образовались (25, 34, 35). Такой состав частиц определяет колонизацию и структуру исходного микробного сообщества (см. Ссылку 54). Из этого следует, что пул таксонов с дисперсными частицами, который тонет и имеет потенциал к процветанию при попадании в более глубокие слои, будет зависеть от местных условий и происхождения частиц в поверхностных водах и должен различаться на разных станциях.Мы проверили эту гипотезу, идентифицировав пул прокариот, прикрепленных к поверхностным частицам, которые увеличили свою относительную численность по направлению к более глубоким водам, которые действуют как семенные OTU. Эти OTU принадлежали к разным таксономическим группам на разных исследованных станциях, что, вероятно, указывает на влияние первоначальных колонизаторов поверхностных частиц на локальное определение сообществ глубоководных микробов. Это означает, что тонущие частицы переносят различные сообщества, но некоторые из этих таксонов [вероятно, спящие или медленно растущие (55)] могут расти и доминировать в глубоководных сообществах, когда окружающие условия окружающей среды или природа частиц меняются, как они есть. переносится в более глубокие воды.Кроме того, другие таксоны могут уменьшать свою относительную численность с глубиной, поскольку они находят неблагоприятные условия при перемещении с поверхности в глубину океана (51). Подобный процесс также наблюдался в других экосистемах, таких как континуум пресной воды от реки к озеру, где было показано, что перенос и рост редких бактерий из наземных источников в значительной степени определяет структуру принимающих водных сообществ (39). Эти результаты совпадают в том, что подчеркивают необходимость учета потенциальных источников распространения для понимания наблюдаемых биогеографических закономерностей.Сосредоточившись на свободноживущих прокариотах, Wilkins et al. (20) предположили, что адвекция масс морской воды может формировать структуру микробного сообщества, увеличивая возможности для колонизации. Однако, учитывая ограниченный глубинный вертикальный перенос воды в открытом океане, тонущие частицы, вероятно, будут играть ключевую роль в определении и формировании вертикальной взаимосвязанности океанических микробных сообществ на большей части мирового океана, обеспечивая непрерывное распространение жизнеспособных организмов в мезопелагическом океане. и батипелагические царства.

Несмотря на общее восприятие однородного темного океана, геномные подходы выявили огромную и динамичную генетическую изменчивость глубоководных микробных сообществ (см. Ссылку 3). Действительно, недавний глобальный обзор прокариотических сообществ в батипелагической области показал, что они различаются между океаническими бассейнами и что этот биогеографический сигнал был сильнее для членов, прикрепленных к частицам (фракция размером 0,8–20 мкм), чем для их свободноживущих собратьев (0,2 –0,8 мкм фракция) (36).Это согласуется с нашим наблюдением, что на всех глубинах сообщества из самых крупных частиц показали гораздо более четкие различия между станциями, чем свободноживущие сообщества ( SI Приложение , Таблица S2). Однако мы заметили, что различия в составе между наземными станциями сообществ, связанных с частицами, коррелировали с различиями в составе между глубоководными станциями, и что сила этой корреляции возрастала с увеличением размера частиц, тогда как для поверхности и поверхности такая закономерность не наблюдалась. .свободноживущие глубинные сообщества (таблица 1). В целом это указывает на то, что биогеография глубоководных сообществ отражает биогеографию вышележащих поверхностных сообществ как следствие опосредованного частицами распространения и, таким образом, частично определяется биогеографией прикрепленного прокариотического сообщества, происходящего на поверхности. Салазар и др. (36) предположили, что подводные горы, разделяющие океан на бассейны, могут действовать как экологические барьеры для прокариотических сообществ, способствуя их дифференциации.Однако этим объясняется небольшая часть различий в составе сообщества. Наши результаты также предполагают, что таксономические различия пула таксонов, прибывающих через тонущие частицы, также могут быть основным механизмом, объясняющим наблюдаемые биогеографические структуры глубоководных прокариот.

В нашем дизайне исследования, основанном на сравнении структуры прокариотических сообществ вдоль вертикальных профилей, мы описали изменчивость состава сообществ вдоль водной толщи в вертикальном градиенте, определяемом четырьмя глубинами, отобранными на каждой станции.Нам известно, что описанные процессы не связаны напрямую по вертикали, потому что горизонтальные скорости переноса могут быть больше, чем скорости погружения. Следовательно, точки отбора проб на каждой глубине должны рассматриваться как репрезентативные образцы более широкой области (т.е. они не должны интерпретироваться как точки, расположенные непосредственно друг над другом, а скорее как вертикальные профили с образцами, представляющими большую площадь). Тем не менее, аналогичные закономерности наблюдались при анализе каждой станции в отдельности ( SI Приложение , рис.S6) и все станции вместе (рис. 2). Кроме того, наблюдаемое сходство в биогеографических паттернах между поверхностными и глубоко прикрепленными сообществами (таблица 1), а также характерная для станции подпись в пуле таксонов, способных расти на тонущих частицах ( SI Приложение , рис. S7). ), по всей видимости, подтверждает, что действительно существует вертикальное соединение в пределах области, представленной каждой станцией выборки.

Таким образом, мы показываем, что прокариотический микробиом глобального океана демонстрирует сильную вертикальную связь через всю толщу воды.Эта связь происходит через опускание частиц, что подчеркивает роль частиц как микробных переносчиков, которые вносят жизнеспособные поверхностные таксоны в глубокие океаны. Кроме того, наши результаты показывают, что во всех местных сообществах преобладают ОТЕ, которые уже присутствуют в поверхностных водах; что есть ОТЕ с поверхности, которые процветают на глубине; и что на биогеографию батипелагической области до некоторой степени влияют события колонизации частицами, происходящие в поверхностных водах. Поэтому вклад как частиц, так и прикрепленных к ним сообществ в батипелагическое царство кажется решающим.К существующим свидетельствам того, что тонущие частицы являются важным источником углерода и питательных веществ для развития гетеротрофной жизни в глубоких океанских глубинах (3, 4), наши результаты добавляют, что сообщества, прикрепленные к частицам, являются источником жизнеспособного разнообразия для более глубоких слоев океана. Учитывая, что батипелагическое царство состоит в основном из медленно тонущих или плавучих частиц (4), которые являются богатыми ресурсами средами обитания микробов (56), и что глубоководные прокариоты более приспособлены к прикрепленному образу жизни, чем поверхностные (57⇓⇓ –60), глубоководная микробная активность и жизнь должны быть сконцентрированы на частицах (3, 6, 57).Следовательно, это управляемое частицами распространение микробов, вероятно, представляет собой фундаментальный механизм, влияющий на структуру, сборку и функционирование глубоководных микробных сообществ по всему Мировому океану.

В заключение мы описываем управляемую частицами вертикальную дисперсию прокариот с поверхности в глубину океана, и наши результаты предполагают множество дополнительных вопросов, которые могут быть исследованы в будущем. Возвращаются ли микробы, которые тонут, когда-нибудь на поверхность океана, или существует механизм распространения, который возвращает их на поверхность? Если переносимые микробы напрямую зависят от процессов, происходящих на поверхности, как изменчивость состава частиц и скорости погружения влияет на сообщества в глубинах океана? Является ли расселение организмов, прибывающих с поверхности, главным процессом, определяющим биогеографию глубоководных океанов? Здесь мы раскрываем важность вертикальной дисперсии, управляемой частицами, но актуальность других механизмов дисперсии в структурировании микробных сообществ океана в глобальном масштабе еще предстоит оценить, механизмы, которые могли бы объяснить, например.g., как организмы, считающиеся эндемиками жерловых систем, могут колонизировать географически и потенциально изолированные отдаленные гидротермальные среды обитания (45). Постулируемое существование глобального банка семян в океане (44) требует выявления различных прокариотических механизмов, ответственных за распространение. Наши результаты свидетельствуют об одном таком механизме, происходящем в глобальном масштабе.

Материалы и методы

Район исследования и отбор проб.

Всего мы отобрали восемь станций из тех, что были взяты во время экспедиции Маласпина 2010 (61) в период с декабря 2010 г. по июль 2011 г.Отобранные станции были распределены в глобальном тропическом и субтропическом океане (между 30 ° северной широты и 40 ° южной широты): три в Атлантическом океане, две в Индийском океане и три в Тихом океане. На каждой станции отбирались пробы четырех глубин, соответствующих поверхности (SFC, 3 м), глубинному максимуму хлорофилла (DCM, 48–150 м), мезопелагическим (MESO, 250–670 м) и батипелагическим водам (BATHY, 3,105–4,000 м). Образцы поверхностной воды отбирались с помощью бутылки Нискина, а пробы воды с других глубин отбирались с помощью розетки бутылок Нискина, прикрепленных к профилометру проводимость-температура-глубина (CTD).Вертикальные профили солености, потенциальной температуры и растворенного кислорода регистрировались непрерывно с помощью датчиков CTD, установленных в розеточном пробоотборнике. Питательные вещества (нитраты, фосфаты и диоксид кремния) определяли с использованием стандартных процедур, как описано в Catalá et al. (62). Численность и размер бактерий определяли с помощью проточной цитометрии, а продукцию гетеротрофных бактерий оценивали с использованием метода включения 3 H-лейцина (63), как подробно описано в ссылке. 64.

Прокариотическая биомасса из фракций разного размера была собрана путем предварительной фильтрации воды через сетку с размером ячеек 200 мкм и последовательного фильтрования 10 л через 20-, 5.Фильтры с размером пор 0, 3,0, 0,8 и 0,2 мкм, все поликарбонатные фильтры 47 мм (фильтр с размером пор 20 мкм от GE Water and Process Technologies и остальные фильтры от Millipore) с использованием перистальтический насос, позволяющий получать фракции пяти различных размеров (0,2–0,8, 0,8–3,0, 3,0–5,0, 5,0–20 и 20–200 мкм). Засорение фильтра или смещение частиц может повлиять на таксономический состав, наблюдаемый в каждой крупной фракции (65), но мы попытались минимизировать эти проблемы, фильтруя с очень низкой скоростью и давлением и часто меняя фильтры.Фильтры быстро замораживали в жидкости N 2 и хранили при -80 ° C до экстракции ДНК. Мы предполагаем, что фракция размером 0,2–0,8 мкм будет содержать в основном свободноживущие прокариотические сообщества, которые остаются взвешенными в толще воды, а остальные фракции размера будут включать прокариоты, связанные с различными типами частиц (например, гели, органические и неорганические частицы). частицы, живые или неживые организмы) различных размеров, которые будут влиять на скорость их опускания. Определим 0.2–0,8 и 0,8–3,0 мкм как фракции малого размера (или мелкие частицы, взвешенные частицы), тогда как 3,0–5,0, 5,0–20 и 20–200 мкм определяются как фракции большого размера (или крупные частицы, тонущие частицы).

Выделение ДНК, секвенирование и обработка последовательностей.

ДНК экстрагировали фенол-хлороформным протоколом (как описано в ссылке 66). Гипервариабельный участок V4 – V5 гена 16S рРНК амплифицировали с помощью ПЦР с праймерами 515F-926R (67) и секвенировали на платформе Illumina MiSeq с использованием метода парных концов 2 × 250 п.н. в Центре научно-исследовательской и испытательной лаборатории (rtlgenomics.com /). Вычислительные анализы проводились на платформе биоинформатики Marbits в Institut de Ciències del Mar. Ампликоны обрабатывались по протоколу (подробно описанному в ссылке 68), основанному на Uparse (69). Вкратце, чтения были собраны с помощью PEAR (Paired-End reAd mergeR) (70), и были отобраны считывания с> 100 нуклеотидами. Проверка качества, дерепликация, кластеризация OTU (99%) и фильтрация химер на основе ссылок (с использованием базы данных Silva v.119) обрабатывались с помощью Usearch (71). Таксономическое назначение OTU было произведено с помощью BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) поиска репрезентативных последовательностей в базе данных Silva v.123. Непрокариотические ОТЕ (эукариоты, хлоропласты и митохондрии), а также одиночные клетки были удалены. Чтобы позволить сравнения между выборками, таблица OTU была случайным образом разбита на подвыборку по количеству считываний, присутствующих в выборке с наименьшим количеством считываний (которое составляло n = 5,390), и всего было получено 13 567 OTU.

Анализ данных.

Статистический анализ и графики были выполнены в R (www.r-project.org) с использованием vegan (72), simba (73), spaa (74), betapart (75) и BiodiversityR (76) пакетов.Богатство OTU каждой размерной фракции и на каждой глубине рассчитывалось с использованием таблицы разреженных OTU, а метрика Брея – Кертиса использовалась в качестве оценки различия сообществ. Чтобы проверить, были ли сообщества структурированы стохастически или нет, был рассчитан индекс RC Bray . Индекс состоит из метрики Раупа – Крика (77) с использованием различий Брея – Кертиса (41). Всего было выполнено 1000 рандомизаций для OTU с> 100 чтениями во всем наборе данных. Сообщества были сгруппированы с использованием неметрического многомерного анализа (nMDS) на основе расстояний Брея-Кертиса.Статистические различия между такими категориями, как размерная фракция, пикет и глубина, были исследованы с помощью перестановочного многомерного анализа дисперсии (PERMANOVA) (функция Адониса, пакет R vegan ).

Чтобы выяснить взаимосвязь между сообществами по всей водной толще определенной фракции, был рассчитан набор параметров для каждой станции отдельно: вертикальное бета-разнообразие (т.е. дифференциация сообществ) было рассчитано с использованием функции trudi из пакета R Симба .Вертикальный оборот OTU (т. Е. Несходство из-за смены видов) и вложенность (т. Е. Несходство из-за потери видов) оценивались с помощью функции beta.multi в пакете R betapart и основывались на индексе Соренсена. Ширина вертикальной ниши каждой OTU была рассчитана с использованием функции niche.width в пакете R spaa и с применением индекса Левинса (78). Ширина ниши определялась как количество различных глубин, на которых появлялись OTU (т.е., OTU со значениями ширины ниши, равными 4, присутствовали на четырех глубинах, тогда как OTU со значениями ширины ниши, равными 1, присутствовали только на одной глубине), и среднее значение всех значений ширины ниши для OTU каждой станции было рассчитано. Чтобы проверить, были ли различия между фракциями малого и большого размера статистически значимыми по параметрам бета-разнообразия, оборачиваемости, вложенности и ширины ниши, был проведен ранжированный критерий Уилкоксона, сравнивающий фракции размером 0,2–0,8 мкм и 20–200 мкм.Корреляции между сообществами из разных фракций и глубин рассчитывались с помощью теста Мантеля (на основе расстояний Брея – Кертиса).

Чтобы различать OTU, доминирующие (т.е. обогащенные, с предпочтением) фракции меньшего и большего размера, мы определили PAN-индекс. PAN-индекс указывает, в какой размерной фракции OTU более многочисленна (и, следовательно, более доминирует над другими OTU), и был рассчитан с использованием взвешенного по численности среднего значения каждой OTU среди пяти размерных фракций.Этот PAN-индекс определяет предпочтение доли размера каждой OTU в континууме размеров (то есть, в какой доле размера OTU является более доминирующей) и является модификацией индекса PAN, представленного в Salazar et al. (52), где учитывались только две размерные фракции (свободноживущие и прикрепленные). Значения индекса PAN варьировались от 1 до 5, и каждое число отражает предпочтение размера данной OTU следующим образом: 1, предпочтение фракции размера 0,2–0,8 мкм; 2, предпочтение от 0,8 до 3,0 мкм; 3, предпочтение 3.0–5,0 мкм; 4, предпочтение от 5,0 до 20 мкм; и 5 — предпочтение фракции размером 20–200 мкм. Значения PAN-индекса представляли бимодальное распределение ( SI Приложение , рис. S4), и мы, следовательно, разделили их на две группы: OTU с PAN-Index ≥ 2.7 (т. Е. Те, которые предпочитают большие частицы) и OTU с PAN. -Index <2.7 (т.е. те, которые предпочитают мелкие частицы). Чтобы идентифицировать пул таксонов, потенциально растущих в тонущих частицах, мы сначала выбрали поверхностные OTU с PAN-Index ≥ 2.7 те, которые демонстрируют наибольшие сдвиги в относительной численности путем расчета евклидова расстояния их относительной численности между всеми парами образцов и выбора OTU со средним расстоянием> 10, следуя Руис-Гонсалесу и др. (39). Затем мы определили те, относительная численность (преобладание) которых увеличивалась к более глубоким слоям (т. Е. Показывающие более высокие средние относительные содержания в мезопелагических и / или батипелагических водах, чем в поверхностных и / или DCM). Это было сделано для каждой станции, и эти OTU были названы исходными OTU, потому что они могут представлять таксоны, засевающие более глубокие сообщества.

Благодарности

Мы благодарим всех ученых и команду за их поддержку во время сбора проб в рейсе Маласпина 2010, и особенно Э. Боррулла, К. Диес-Вивеса, Э. Лара, Д. Ваке, Г. Салазара и Ф. Корнехо-Кастильо для отбора проб ДНК. К. Антекера любезно предоставил лабораторную помощь при выделении ДНК. Мы также благодарны Г. Салазару за его помощь в адаптации индекса PAN к фракционированию по нескольким размерам. Мы благодарим платформу биоинформатики Marbits Института Китая дель Мар в Барселоне и особенно Пабло Санчеса за компьютерную поддержку.М.М. была поддержана Высшим советом по расследованию сентификас-хунта пара ла Амплиасион де Estudios Grant (CSIC-JAE-Predoc Grant) и Министерством труда, занятости и социального обеспечения. R.L. был поддержан стипендией Рамона и Кахала (RYC-2013-12554, Ministerio de Economía y Competitividad (MINECO), Испания) и C.R.-G. был поддержан стипендией Хуана де ла Сьервы (IJCI-2015-23505). Это вклад в экспедицию Malaspina 2010, финансируемую Министерством экономики и конкурентоспособности Испании в рамках программы Consolider-Ingenio (Ссылка CSD2008-00077).

  • Copyright © 2018 Автор (ы). Опубликовано PNAS.

Полуавтоматический отбор криоЭМ частиц в РЕЛИОН-1.3

2.1. Сбор частиц

Предложенный алгоритм отбора частиц на основе шаблона использует аддитивную модель с белым гауссовским шумом в реальном пространстве. Микрофотография X , которая содержит N отдельных частиц i в координатах t → i на микрофотографии, описывается следующим образом (см. Также A):

X (r →) = μ (r →) + σ (r →) ∗ N (r →) + ∑i = 1NAkiϕi (r → -t → i),

(1)

где:

  • • X (r →) — это микрофотография, т.е.е. двумерное изображение, которое было записано в электронный микроскоп, и r описывает двухмерное положение на этом изображении.
  • • N (r →) — изображение независимого (или белого) гауссовского шума с нулевым средним и единичным стандартным отклонением.
  • • μ (r →) и σ (r →) — это позиционно-зависимые аддитивные и мультипликативные коэффициенты нормализации , которые приводят зарегистрированные уровни шума на микрофотографии к нулю и среднему значению стандартного отклонения. Вариации μ и σ с положением обычно описывают экспериментальные изменения толщины льда, дозы электронов, и т. Д. .
  • • Akiϕi — один из известных K , двухмерный шаблон изображений A k с внутренними позициями q →. Обычно изображения шаблона намного меньше, чем микрофотография (в суммировании выше, изображение шаблона имеет нулевое значение за пределами определенного размера коробки). Следовательно, для любого заданного r → и шаблона A k i в позиции t → i внутренняя позиция будет q → = r → -t → i. Различные изображения шаблона K могут описывать проекции одной и той же молекулы в разных направлениях или они могут описывать проекции разных молекул; k i описывает, какое из шаблонных изображений соответствует i -й частице; и ϕ i описывает относительное вращение в плоскости между частицей и этим шаблоном изображения.

Схематическое изображение модели данных. (A) Представление микрофотографии с векторами координат r = ( r x , r y ) внутри микрофотографии и векторами координат q = ( q x , q y ) внутри каждого изображения частицы. Векторы t i = ( t x , t y ) поместите частицу i th внутри микрофотографии с неизвестным вращением в плоскости ϕ i относительно общей системы координат.Вставка (B), маска M o , которая используется для нормализации изображений частиц: среднее и стандартное отклонение пикселей фона вычисляются в белой области этой маски. Вставка (C), маска M i , которая используется для алгоритма сортировки частиц: вся статистика по разностным изображениям между каждой частицей и соответствующим ей шаблоном вычисляется в белой области этой маски.

Учитывая X (r →) и K изображений шаблона A k , задача состоит в том, чтобы идентифицировать все N комбинаций t → i, ϕi и k i .Основываясь на положительном опыте применения подходов максимальной вероятности, например см. (Scheres et al., 2007; Scheres, 2012a), выбор был сделан для реализации метрики подобия, основанной на вероятности, для этой задачи. Предположение о гауссовском шуме в формуле. (1) естественным образом приводит к гауссовской мере подобия. В отличие от коэффициента взаимной корреляции, который используется, например, в основанной на шаблоне программе выбора findEM (Roseman, 2003, 2004), квадрат разности внутри гауссовой метрики не инвариантен к умножению или сложению константы.Это означает, что необходимо учитывать различные уровни интенсивности на записанных микрофотографиях, а также необходимо определить коэффициенты нормализации μ (r →) и σ (r →), чтобы привести все частицы к одному и тому же уровню интенсивности.

После извлечения отдельных частиц из микрофотографий, RELION полагается на процедуру нормализации, которая использует круг (с заданным пользователем радиусом R , см. B) для разделения каждого извлеченного изображения частицы в области фона (за пределами круга) и область частицы (внутри того же круга) (Sorzano et al., 2004). Путем вычитания среднего значения пикселей в области фона из всего изображения частицы и последующего деления всего изображения на стандартное отклонение пикселей в области фона, уровни шума с нулевым средним и единичным стандартным отклонением получаются для все частицы, независимо от изменений толщины льда, воздействия или других неконтролируемых экспериментальных факторов.

Та же процедура нормализации используется внутри реализованной процедуры отбора частиц.Используя те же концепции, что и в алгоритме быстрой локальной корреляции внутри findEM (Roseman, 2003, 2004), значения μ (r →) и σ (r →) могут быть эффективно предварительно вычислены для всех r → с использованием быстрых преобразований Фурье (БПФ):

μ (r →) = 1MoFT-1FT (X) FT (Mo) ∗,

(2)

σ (r →) = 1MoFT-1FT (X2) FT (Mo) ∗ — μ2 (r →) ,

(3)

, где FT и FT -1 обозначают операции прямого и обратного преобразования Фурье, ∗ обозначает комплексное сопряжение, а M o представляет собой двоичную маску, как показано на B с M o белых пикселей.Вторая маска M i является инверсией M o и имеет M i белых пикселей (C).

Учитывая модель данных в формуле. (1) вероятность наблюдения микрофотографии с частицей, соответствующей шаблонному изображению A k в ориентации ϕ и положении t →, затем определяется умножением гауссиана (со стандартным отклонением, равным единице). ) для каждого пикселя q → внутри маски M i :

PX | t →, Akϕ∝exp∑q → ∈Mi-12X (q → + t →) -μ (r →) σ (r →) -Akϕ (q →) 2.

(4)

Диапазон значений P (X | t →, Akϕ) зависит от количества пикселей внутри маски M i и мощности сигнала в Akϕ. Чтобы определить метрику подобия с заранее заданным диапазоном, также вычисляется вероятность наблюдения микрофотографии только с шумом в этой позиции, то есть как для шаблонного изображения с нулевыми значениями O :

P (X | t →, O) ∝exp∑q → ∈Mi-12X (q → + t →) -μ (r →) σ (r →) 2.

(5)

Затем вычисляется отношение P (X | t →, Akϕ) и P (X | t →, O), которое будет обозначаться как Rϕ, k (t →), используя:

Rϕ, k (t →) = P (X | t →, Akϕ) P (X | t →, O) = exp∑q → ∈MiX (q → + t →) Akϕ (q →) σ (r → ) -μ (r →) Akϕ (q →) σ (r →) -12Akϕ (q →) 2.

(6)

Если Rϕ, k (t →)> 1, позиция t → скорее соответствует частице Akϕ, чем растворителю. Ожидаемое значение Rϕ, k (t →) для изображения в соответствии с моделью данных в формуле. (1) рассчитывается как:

E 〈Rk〉 = exp12Mi∑q → ∈MiAk2.

(7)

Следовательно, можно определить метрику подобия, которая принимает значения в значимом диапазоне, выражая дробь:

Sϕ, k (t →) = Rϕ, k (t →) -1E 〈Rk〉 — 1.

(8)

Значение Rϕ, k (t →) -1 выражает, насколько более вероятно, что положение t → соответствует частице Akϕ, чем растворителю.Для идеального сигнала и белого гауссовского шума это значение будет близко к E R k 〉 — 1. На практике шаблоны не идеальны, а шум не белый, что приводит к типичным значениям. Rϕ, k (t →) -1 меньше, чем E R k 〉 — 1. Следовательно, полезные пороговые значения для поиска пика в Sϕ, k (t →) часто лежат в диапазоне (0,1].

Расчет Sϕ, k (t →) для всех ϕ и k можно эффективно выполнить следующим образом.Вычисление ∑q → ∈MiAkϕ и ∑q → ∈MiAkϕ2 инвариантно для t → и ϕ , и поэтому его необходимо вычислять только один раз для каждого шаблона. Расчет оставшихся неизвестных в уравнении. (6) для всех t →, k и ϕ снова может быть вычислено с использованием кросс-корреляции с ускорением БПФ:

∑q → ∈MiX (q → + t →) Akϕ (q →) = FT-1FT (X ) FT (Akϕ) ∗,

(9)

при условии, что Akϕ (q →) = 0 при q → ∉Mi. Для каждого изображения шаблона A k и каждого дискретного вращения в плоскости ϕ = 1,…, Φ вычисляется Sϕ, k (t →) для всех t →.Это включает в себя K × Φ оценок уравнения. (9), тогда как уравнения. (2) и (3) необходимо оценивать только один раз для каждой микрофотографии. Пользователь управляет Φ посредством определения угловой частоты дискретизации (обычно 5 градусов). Используемые библиотеки БПФ работают только с квадратными изображениями. Прямоугольные микрофотографии дополняются белым гауссовским шумом для получения изображений в квадрате. Это делается внутренне, поэтому взаимодействие с пользователем не меняется.

Поиск пика сначала выполняется независимо для всех Sϕ, k (t →).Возможные положения частиц выбираются только для локальных максимумов (где четыре соседних пикселя меньше пикового значения) и если пиковое значение выше заданного пользователем порога. Для каждого изображения Sϕ, k (t →) пики обрезаются на основе определяемого пользователем минимального расстояния между частицами. Все пики на этом расстоянии друг от друга сгруппированы вместе. Внутри каждого кластера сохраняется пик с наибольшим значением Sϕ, k (t →), а оставшиеся пики в пределах минимального расстояния между частицами сохраняемого пика отбрасываются.Это делается рекурсивно, так что можно сохранить более одного пика от каждого кластера, но все обрезанные пики будут находиться, по крайней мере, на минимальном расстоянии между частицами друг от друга. Отсеченные пики для всех шаблонов k и все вращения в плоскости ϕ затем объединяются, и объединенный список пиков сокращается с использованием того же алгоритма. Окончательный результат, если список N координат частицы ti →, каждая со значением для соответствующего шаблона k i и вращением в плоскости ϕ i .

Хотя явно не написано как таковое в формуле. (1), реализация в RELION-1.3 выполняется таким образом, что предоставляются изображения шаблонов с исправлением CTF, и что внутренне A k вычисляется путем применения заданной функции передачи контрастности (CTF) микрофотография к шаблонным изображениям. Таким образом, получается полностью скорректированный с помощью CTF алгоритм выбора.

2.2. Сортировка частиц

Новый алгоритм сортировки обеспечивает быстрый способ идентифицировать неправильно выбранные частицы из данных.Для каждого извлеченного изображения частицы P, i программа сортировки вычитает ассоциированное изображение шаблона A k в его заданной плоскости ϕ . Полученное разностное изображение используется для вычисления произвольного количества статистических признаков. Если P i соответствует истинной частице, то разностное изображение должно содержать только фоновый шум. Если P i было неправильно выбрано как частица, то разностное изображение будет содержать особенности, которые нельзя описать только фоновым шумом.Поскольку сортировка зависит от наличия шаблонного изображения, ее можно выполнять на любом этапе обработки изображения, когда каждой частице назначено 2D-изображение шаблона: то есть сразу после автоматического выбора или после любого 2D или 3D классификация или уточнение. После двухмерной классификации и автоматического выбора A k будет соответствовать одному из используемых 2D-шаблонов K ; после трехмерной классификации или уточнения A k будет соответствовать проекциям трехмерных шаблонов в заданном направлении.

Сам алгоритм сортировки аналогичен описанному в Scheres (2010), где вычисляется оценка Z для произвольного количества признаков в каждой частице, а затем все частицы сортируются на основе среднего значения всех этих Z — баллы. Все функции алгоритма сортировки в RELION основаны на различии изображений между каждой частицей и ее выровненным шаблоном. В частности, они включают среднее значение, стандартное отклонение, асимметрию и эксцесс разностного изображения; а также стандартное отклонение между стандартными отклонениями, рассчитанными в четырех квадрантах разностного изображения.Все эти значения рассчитываются в пределах маски M i (C).

Полученные в результате средние баллы Z могут затем использоваться для отображения частиц в отсортированном виде. Частицы с высоким средним баллом Z часто являются высококонтрастными ложными срабатываниями, такими как лед, белковые агрегаты, угольные края или куски мусора, например C. Следовательно, визуальный контроль частиц на верхнем уровне отсортированных средних баллов Z может быть более эффективным способом избавления от плохих частиц, чем проверка всего набора данных.

Выбор частиц для данных KLH. (A) Десять средних классов без опорных значений (упорядоченных от большего к меньшему классам), которые были рассчитаны на основе вручную выбранных частиц. Два класса, отмеченные звездочкой, были выбраны в качестве шаблонов для автоматического выбора. (B) Кривые точности, отзыва и частоты ложных открытий относительно порогового значения выбора. Был выбран порог комплектации 0,3. (C) 15 частиц с наивысшим средним баллом Z после сортировки. (D) 15 самых больших классов (упорядоченных от большего к меньшему) после двухмерного усреднения автоматически выбранных частиц.Частицы, отнесенные к классам, отмеченным звездочкой, были отобраны для последующего трехмерного уточнения. (E) 3D-карта после уточнения полуавтоматически выбранных частиц из комбинированных наборов данных KLH, близких к фокусу (NTF) и далеко от фокуса (FFF).

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован.